RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ADH1AP07327 375 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 IRS1P35568 1242 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 LIMK2P53671 638 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ALFQ53S48 1182 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 IPMKQ8NFU5 416 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC3Q9BY71 257 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TRANK1O15050 2925 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 GRM6O15303 877 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 PCID2Q5JVF3 399 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ASRGL1Q7L266 308 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ISL2Q96A47 359 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC22A12Q96S37 553 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 AGAP2Q99490 1192 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TLR9Q9NR96 1032 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 HLA-DQB2P05538 268 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 C8AP07357 584 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 NMBRP28336 390 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINB8P50452 374 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 MPP3Q13368 585 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 SHHQ15465 462 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TMC8Q8IU68 726 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 DCLK2Q8N568 766 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 NACA2Q9H009 215 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNK13Q9HB14 408 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX15Q9NRS6 342 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 DRGXA6NNA5 263 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TIMM44O43615 452 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 PLIN3O60664 434 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 KLKB1P03952 638 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNJ2P63252 427 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 GAREM2Q75VX8 874 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 FATE1Q969F0 183 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 FICDQ9BVA6 458 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 EMCNQ9ULC0 261 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 MGRN1O60291 552 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 STC2O76061 302 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CA3P07451 260 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC6A4P31645 630 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEA12P43365 314 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP3CCP48454 512 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 RENBPP51606 427 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CLCN4P51793 760 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 IRX4P78413 519 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 OCRLQ01968 901 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 STX3Q13277 289 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 C16orf46Q6P387 395 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 POTEHQ6S545 545 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ITIH5Q86UX2 942 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 HEY2Q9UBP5 337 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-211ENST00000539589 NOTCH4Q99466 2003 aa20.52■□□□□ 0.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SNNO75324 88 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms