RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 ADRA1AP35348 466 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 CD86P42081 329 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 CRADDP78560 199 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 PRPSAP1Q14558 356 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 FUT11Q495W5 492 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 PSKH2Q96QS6 385 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 CASS4Q9NQ75 786 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SKOR1P84550 965 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 GAB4Q2WGN9 574 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF135Q8IUD6 432 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SEMA3CQ99985 751 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SEPT3Q9UH03 358 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXO10Q9UK96 956 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ANXA9O76027 345 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 CISD3P0C7P0 127 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 MLNP12872 115 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF235Q14590 738 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM215Q68D42 235 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 C12orf40Q86WS4 652 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 IPMKQ8NFU5 416 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 EXOC2Q96KP1 924 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 MGME1Q9BQP7 344 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 HPS4Q9NQG7 708 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 TMCC1O94876 653 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 TPH1P17752 444 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 CR2P20023 1033 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 MGAT1P26572 445 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SSTR1P30872 391 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 GEMP55040 296 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 WNT3AP56704 352 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 MESP2Q0VG99 397 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 TDGQ13569 410 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 GRM2Q14416 872 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 DENND2CQ68D51 928 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 NOD2Q9HC29 1040 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 GGA2Q9UJY4 613 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ASGR2P07307 311 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 NUDT17P0C025 328 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ADH5P11766 374 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF844Q08AG5 666 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC38Q502W7 563 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 RANBP10Q6VN20 620 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 GJD3Q8N144 294 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 FICDQ9BVA6 458 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 LHX3Q9UBR4 397 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 PSMD3O43242 534 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 CHRNA4P43681 627 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC6A11P48066 632 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC12A1Q13621 1099 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 PDGFRLQ15198 375 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 PCSK7Q16549 785 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ACDQ96AP0 544 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 BRD9Q9H8M2 597 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 GDI1P31150 447 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-209ENST00000532457 MPP3Q13368 585 aa22.23■■□□□ 1.15
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