RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519813.1

TMPRSS4-208, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMPRSS4, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-208ENST00000519813 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 ATP4BP51164 291 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC5A3P53794 718 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 TBX4P57082 545 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 KDSRQ06136 332 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZBTB17Q13105 803 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 KLF10Q13118 480 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 MTM1Q13496 603 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 SERINC3Q13530 473 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 RCN1Q15293 331 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 CCL14Q16627 93 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 C5orf22Q49AR2 442 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 ACCSLQ4AC99 568 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 CXCL17Q6UXB2 119 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 NPWQ8N729 165 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 KYQ8NBH2 561 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 RHEBL1Q8TAI7 183 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 TADA1Q96BN2 335 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 MAGEH1Q9H213 219 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 TASP1Q9H6P5 420 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 SYTL2Q9HCH5 934 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 COX16Q9P0S2 106 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 STK39Q9UEW8 545 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 MAFFQ9ULX9 164 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 CDYLQ9Y232 598 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 NOD1Q9Y239 953 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 VWA7Q9Y334 891 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 PSAT1Q9Y617 370 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 TRIP11Q15643 1979 aa7.37□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 MROH6A6NGR9 719 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 A8MUI8 341 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 DFFAO00273 331 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 HCRTO43612 131 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 ITM2AO43736 263 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 TBX10O75333 385 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 VAPBO95292 243 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 FGF1P05230 155 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 COX4I1P13073 169 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 GM2AP17900 193 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 OGNP20774 298 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 IMPDH1P20839 514 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 NMBRP28336 390 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 GRIA4P48058 902 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 HSPA13P48723 471 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 TUFMP49411 452 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 ACADVLP49748 655 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 MTTPP55157 894 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 CRADDP78560 199 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 NFKB2Q00653 900 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 DSG1Q02413 1049 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 ACVR1Q04771 509 aa7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TMPRSS4-208ENST00000519813 ITGA7Q13683 1181 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms