RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516223.1

RNU6-1281P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1281, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1281P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1281P-201ENST00000516223 IL13RA2Q14627 380 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ZNF484Q5JVG2 852 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 LCE1EQ5T753 118 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GJB7Q6PEY0 223 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 USP43Q70EL4 1123 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SPICE1Q8N0Z3 855 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GPT2Q8TD30 523 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 THAP4Q8WY91 577 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NCSTNQ92542 709 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NR4A3Q92570 626 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GOLGA1Q92805 767 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 OCIAD1Q9NX40 245 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NLKQ9UBE8 527 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 HDAC6Q9UBN7 1215 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 A0A1B0GVM2 712 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 HBP1O60381 514 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CAMTA2O94983 1202 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TNNT1P13805 278 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FAM27E3Q08E93 113 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ST3GAL1Q11201 340 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TIGD6Q17RP2 521 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FAM76BQ5HYJ3 339 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 WBP2NLQ6ICG8 309 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SETD9Q8NE22 299 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 LINS1Q8NG48 757 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TXNDC15Q96J42 360 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MDFICQ9P1T7 246 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CD207Q9UJ71 328 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 A0A0U1RQJ8 604 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DYTNA2CJ06 578 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CHL1O00533 1208 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 KRT36O76013 467 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 IL1AP01583 271 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CTPS1P17812 591 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ADD2P35612 726 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 PTPN9P43378 593 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CENPAP49450 140 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SLC18A2Q05940 514 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CUL4BQ13620 913 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MORC3Q14149 939 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SLC39A14Q15043 492 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ME3Q16798 604 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ZNF718Q3SXZ3 478 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DCAF6Q58WW2 860 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ZNF329Q86UD4 541 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ZMIZ2Q8NF64 920 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MASTLQ96GX5 879 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 IGSF21Q96ID5 467 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GAREM1Q9H706 876 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TMEM51Q9NW97 253 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TAGLN3Q9UI15 199 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SCN5AQ14524 2016 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SERPINC1P01008 464 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TK1P04183 234 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 MYF6P23409 242 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DLX5P56178 289 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 GOLGA8FQ08AF8 430 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TRIM14Q14142 442 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 LPIN1Q14693 890 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 KRT72Q14CN4 511 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 BRD3Q15059 726 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 TUBB8Q3ZCM7 444 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 CBWD5Q5RIA9 395 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SH2D4BQ5SQS7 431 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 FAM83BQ5T0W9 1011 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DENND1BQ6P3S1 775 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-1281P-201ENST00000516223 SAMD3Q8N6K7 520 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms