RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 LGI2Q8N0V4 545 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 AZIN2Q96A70 460 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TADA1Q96BN2 335 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PLD4Q96BZ4 506 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM169Q96HH4 297 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 VPS39Q96JC1 886 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF558Q96NG5 402 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 KLHL5Q96PQ7 755 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MYLK2Q9H1R3 596 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TREX1Q9NSU2 369 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 COCHO43405 550 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PRAMEF11O60813 436 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SIN3BO75182 1162 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SNNO75324 88 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RASSF9O75901 435 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PRKCGP05129 697 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MPOP05164 745 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HADHAP40939 763 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CD86P42081 329 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SLC11A2P49281 568 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CSRP3P50461 194 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MAXP61244 160 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PPM1JQ5JR12 505 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CES4AQ5XG92 561 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 C16orf46Q6P387 395 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC14AQ86T13 490 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF354CQ86Y25 554 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ERP27Q96DN0 273 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RANBP9Q96S59 729 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 GPR22Q99680 433 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 NACA2Q9H009 215 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PRO3102Q9H379 93 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RHOJQ9H4E5 214 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ECT2Q9H8V3 914 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 KCNK13Q9HB14 408 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 YIPF1Q9Y548 306 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TRANK1O15050 2925 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC78A2IDD5 438 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CARNS1A5YM72 827 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP73A6NFT4 308 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 UNC5CO95185 931 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PROCP04070 461 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 LAG3P18627 525 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PAMP19021 973 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ARNTP27540 789 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ACVRL1P37023 503 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CHRNA4P43681 627 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ALDH1A3P47895 512 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CDH4P55283 916 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DSC2Q02487 901 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ITKQ08881 620 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RAB33AQ14088 237 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 IHHQ14623 411 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PCLAFQ15004 111 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PCSK7Q16549 785 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 UGP2Q16851 508 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC153Q494R4 210 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MBLAC2Q68D91 279 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PGBD5Q8N414 524 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF599Q96NL3 588 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 YME1L1Q96TA2 773 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEH1Q9H213 219 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PDFQ9HBH1 243 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SLC40A1Q9NP59 571 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM216Q9P0N5 145 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 A0A096LPK6 155 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0G2JND7 137 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HEATR9A2RTY3 570 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 GRXCR1A8MXD5 290 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TLL1O43897 1013 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 STC2O76061 302 aa8.29□□□□□ -1.08
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