RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ERAP2	Q6P179	960 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC7B	Q86TV6	843 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	IQCH	Q86VS3	1027 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	HORMAD1	Q86X24	394 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	KCTD6	Q8NC69	237 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	HMCES	Q96FZ2	354 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC6A18	Q96N87	628 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC7	Q99615	494 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SARDH	Q9UL12	918 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PQ67	120 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PQU0	124 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TLR4	O00206	839 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TM4SF5	O14894	197 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MFAP3L	O75121	409 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	UGT2B4	P06133	528 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ITGAV	P06756	1048 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ADRB3	P13945	408 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ERCC2	P18074	760 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINA4	P29622	427 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	GRK6	P43250	576 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CDH6	P55285	790 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ELP6	Q0PNE2	266 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF235	Q14590	738 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SPA17	Q15506	151 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF19	Q2TAC6	998 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	AGBL4	Q5VU57	503 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NAXD	Q8IW45	347 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CHST14	Q8NCH0	376 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SEPT3	Q9UH03	358 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	FPGT	O14772	594 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC31A1	O15431	190 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	LAT	O43561	262 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	AP1G1	O43747	822 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CTSL	P07711	333 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM253	P0C7T8	217 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	GJC1	P36383	396 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP25	P42331	645 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	IL10RB	Q08334	325 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PDK2	Q15119	407 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	SARM1	Q6SZW1	724 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF599	Q96NL3	588 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	CALN1	Q9BXU9	219 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TTLL3-231	ENST00000496246	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		11.5	□□□□□ -0.57

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