RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	HORMAD1	Q86X24	394 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	VSTM4	Q8IW00	320 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	NUP85	Q9BW27	656 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	KLC2	Q9H0B6	622 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ACACB	O00763	2458 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SPEG	Q15772	3267 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327		A0A1B0GTQ1	180 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327		A0A1W2PQU0	124 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327		H0Y8X5	98 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	WNT9A	O14904	365 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	MAGEC1	O60732	1142 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	PRAMEF11	O60813	436 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CBFA2T3	O75081	653 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ERCC2	P18074	760 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	IL1R2	P27930	398 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	NXPH1	P58417	271 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	OVGP1	Q12889	678 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	DPYS	Q14117	519 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	NFKBIB	Q15653	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SLC18A3	Q16572	532 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	BOLA3	Q53S33	107 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	GLRX5	Q86SX6	157 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	OXR1	Q8N573	874 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	RNF214	Q8ND24	703 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TEKT4	Q8WW24	435 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	RAB7B	Q96AH8	199 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ZWILCH	Q9H900	591 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	GDF3	Q9NR23	364 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	LHX3	Q9UBR4	397 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	WASF3	Q9UPY6	502 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327		H3BRJ5	948 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TLR4	O00206	839 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	KRIT1	O00522	736 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	YKT6	O15498	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	DAPK3	O43293	454 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	MFAP3L	O75121	409 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	UGT2B4	P06133	528 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TPM1	P09493	284 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	TCF4	P15884	667 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	GK	P32189	559 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	RHOA	P61586	193 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	RAD51	Q06609	339 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF284	Q2VY69	593 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	MYLK3	Q32MK0	819 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	INAVA	Q3KP66	663 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	LZTR1	Q8N653	840 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	NPW	Q8N729	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM28-208	ENST00000495327	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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