RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 LHX1P48742 406 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TUBP50607 506 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SLC18A2Q05940 514 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TPSAB1Q15661 275 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TKTL2Q9H0I9 626 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 WDCPQ9H6R7 721 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 HEY2Q9UBP5 337 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FAM92AA1XBS5 289 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CFAP73A6NFT4 308 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA8TH3BQL2 631 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MGRN1O60291 552 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 UNC5CO95185 931 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 OR4Q2P0C623 313 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TPH1P17752 444 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FCARP24071 287 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MAGEA6P43360 314 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CHI3L2Q15782 390 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 C16orf87Q6PH81 154 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ARCQ7LC44 396 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NT5C3BQ969T7 300 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MYRFLQ96LU7 910 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SLC2A13Q96QE2 648 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SPATA7Q9P0W8 599 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DPPA5A6NC42 116 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 OPHN1O60890 802 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DCTN3O75935 186 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 OLFM2O95897 454 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZNF24P17028 368 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SERPINB3P29508 390 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 IRS1P35568 1242 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FDFT1P37268 417 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MAGEA3P43357 314 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ARFIP2P53365 341 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PDE1BQ01064 536 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 BST1Q10588 318 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DPYSQ14117 519 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 UPP1Q16831 310 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TTC7BQ86TV6 843 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 AZIN2Q96A70 460 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LRRC39Q96DD0 335 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZNF570Q96NI8 536 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ARMCX1Q9P291 453 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PLLPQ9Y342 182 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FAM159BA6NKW6 160 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 HACD1B0YJ81 288 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZNF487B1APH4 448 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DCLK1O15075 740 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MSI1O43347 362 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 LRIG2O94898 1065 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 JCHAINP01591 159 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MYL2P10916 166 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PTPN3P26045 913 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PCSK1P29120 753 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 MAGEA11P43364 429 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 BLMHQ13867 455 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PPM1JQ5JR12 505 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CES4AQ5XG92 561 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 KDELC2Q7Z4H8 507 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 TAC4Q86UU9 113 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ARNTL2Q8WYA1 636 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 SPATA17Q96L03 361 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC4-211ENST00000492996 CNGB3Q9NQW8 809 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms