RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	LMO7DN	F2Z398	122 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	FPGT	O14772	594 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	IKBKB	O14920	756 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	MCF2L	O15068	1137 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	MUSK	O15146	869 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	EXOC3	O60645	756 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	RTN2	O75298	545 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	TNFRSF8	P28908	595 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	ADH7	P40394	386 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	CASP5	P51878	434 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	NUCB2	P80303	420 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	MTA1	Q13330	715 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	CLCA4	Q14CN2	919 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	ELOC	Q15369	112 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	TGIF1	Q15583	401 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	RAB41	Q5JT25	222 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	AGBL4	Q5VU57	503 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813		Q6ZSR6	202 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	SKAP1	Q86WV1	359 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	SCML4	Q8N228	414 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	TEX19	Q8NA77	164 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	FEM1C	Q96JP0	617 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	FAM84A	Q96KN4	292 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	LMLN	Q96KR4	655 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-216	ENST00000490813	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813		A0A1W2PQU0	124 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813		D6RAR5	112 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	NEBL	O76041	1014 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	CNTN5	O94779	1100 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	PCDH8	O95206	1070 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	PRNP	P04156	253 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	ALPI	P09923	528 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	PNLIP	P16233	465 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	MAN1A1	P33908	653 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	STAT6	P42226	847 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	CYP2J2	P51589	502 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	TKTL1	P51854	596 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	THOP1	P52888	689 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	PLK1	P53350	603 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	YPEL5	P62699	121 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	CNTN1	Q12860	1018 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	SGCG	Q13326	291 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	ZACN	Q401N2	412 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	BRAP	Q7Z569	592 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	ARL10	Q8N8L6	244 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	TMIE	Q8NEW7	156 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	LMX1A	Q8TE12	382 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	ASB12	Q8WXK4	309 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	SERPINB11	Q96P15	392 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	TNMD	Q9H2S6	317 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-216	ENST00000490813	CUEDC2	Q9H467	287 aa		5.77	□□□□□ -1.49

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