RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 GAS2L3Q86XJ1 694 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 CNGA4Q8IV77 575 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 OR2AP1Q8NGE2 309 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 KLK6Q92876 244 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 VOPP1Q96AW1 172 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 SERAC1Q96JX3 654 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 EXOC2Q96KP1 924 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 CSPG4P5Q96PW8 444 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 HDAC8Q9BY41 377 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 GAREM1Q9H706 876 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 PCDH18Q9HCL0 1135 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 OSGEPQ9NPF4 335 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 DONSONQ9NYP3 566 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 UVRAGQ9P2Y5 699 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-214ENST00000490425 A0A1W2PQU0 124 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 ARHGAP42A6NI28 874 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 LATO43561 262 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 PRAMEF11O60813 436 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 GJB3O75712 270 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 PCDH8O95206 1070 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 WNT1P04628 370 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 CD48P09326 243 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 TMEM253P0C7T8 217 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 CD59P13987 128 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 PRLRP16471 622 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 ITGB7P26010 798 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 ARL4AP40617 200 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 GRIA4P48058 902 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 ZNF75DP51815 510 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 TAS2R40P59535 323 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 RHOAP61586 193 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 RACK1P63244 317 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 POLNQ7Z5Q5 900 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 PLPP6Q8IY26 295 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 TC2NQ8N9U0 490 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 TEKT4Q8WW24 435 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 PPP1R16AQ96I34 528 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 MYOCQ99972 504 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 PDFQ9HBH1 243 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 PREBQ9HCU5 417 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 KLHL11Q9NVR0 708 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 LHX3Q9UBR4 397 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 CA5BQ9Y2D0 317 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 C16orf96A6NNT2 1141 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 POP4O95707 220 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 IGSF6O95976 241 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 ADRB3P13945 408 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 CD38P28907 300 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 ABL2P42684 1182 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 CTSKP43235 329 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 NEK3P51956 506 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 CDH6P55285 790 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 C21orf59P57076 290 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 FOXK2Q01167 660 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 CCDC15Q0P6D6 951 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 MMRN1Q13201 1228 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 KRT81Q14533 505 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 MESDQ14696 234 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 LRRC73Q5JTD7 316 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 FBXL19Q6PCT2 694 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 IL27RAQ6UWB1 636 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 PIP4P1Q86T03 277 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 TRIM69Q86WT6 500 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 SLC35G2Q8TBE7 412 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 TSC1Q92574 1164 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 KLHL32Q96NJ5 620 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 CAMK1GQ96NX5 476 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 SP110Q9HB58 689 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 TPRP12270 2363 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 PCNX2A6NKB5 2137 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 FRYQ5TBA9 3013 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 A0A1W2PR77 199 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 H0Y8X5 98 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 VILLO15195 856 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 SLC31A1O15431 190 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 SH3BP5O60239 455 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 PIGNO95427 931 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-214ENST00000490425 CER1O95813 267 aa12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms