RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	ACSL3	O95573	720 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	GOT1	P17174	413 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	BDNF	P23560	247 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	GCA	P28676	217 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	RBL1	P28749	1068 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PHB	P35232	272 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	FDFT1	P37268	417 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP5O	P48047	213 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC5A3	P53794	718 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	GPX6	P59796	221 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	GNGT1	P63211	74 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	MTA1	Q13330	715 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PDK1	Q15118	436 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ZSCAN26	Q16670	478 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ARMC3	Q5W041	872 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	AFMID	Q63HM1	303 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATC1	Q76KD6	591 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SCD5	Q86SK9	330 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TAC4	Q86UU9	113 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC25	Q86WR0	208 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR65	Q8IYL9	337 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	LILRB2	Q8N423	598 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	MZB1	Q8WU39	189 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	FATE1	Q969F0	183 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	MISP3	Q96FF7	219 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC39A13	Q96H72	371 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA17	Q96L03	361 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	C9orf72	Q96LT7	481 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PWWP2A	Q96N64	755 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TSGA13	Q96PP4	275 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	KLC2	Q9H0B6	622 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	MARCH5	Q9NX47	278 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	HTT	P42858	3142 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247		F8W810	466 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CAPN9	O14815	690 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNN4	O15554	427 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL18	O95568	372 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM107A	O95990	144 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	VAV1	P15498	845 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	ERCC2	P18074	760 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PRKCH	P24723	683 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINB6	P35237	376 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	RFC2	P35250	354 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	KIR3DL1	P43629	444 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	CLCN7	P51798	805 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	GALNT2	Q10471	571 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	WASHC5	Q12768	1159 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR17	Q13304	367 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	LONRF1	Q17RB8	773 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	TCTN1	Q2MV58	587 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	PARP6	Q2NL67	630 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5

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