RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488015.5

SRI-208, Transcript of sorcin, human

TSL 2

Gene SRI, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRI-208	ENST00000488015	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	PSMG2	Q969U7	264 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	FZD8	Q9H461	694 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015		K7EQS6	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	MATN2	O00339	956 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ACKR2	O00590	384 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	SLC37A4	O43826	429 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	RFPL1	O75677	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	IL33	O95760	270 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	PF4V1	P10720	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	HLA-E	P13747	358 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	IFNAR2	P48551	515 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	BPIFB4	P59827	614 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	RAC3	P60763	192 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ADAM8	P78325	824 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	NUCB1	Q02818	461 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ZNF33A	Q06730	810 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	GPR17	Q13304	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	SURF1	Q15526	300 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	USP37	Q86T82	979 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ANK1	P16157	1881 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015		E9PAM4	449 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	SGK1	O00141	431 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	PLK4	O00444	970 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	MTSS1	O43312	755 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	TSPAN6	O43657	245 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	SLC28A2	O43868	658 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	AKR1B10	O60218	316 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	SLITRK3	O94933	977 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	OAZ2	O95190	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	EDN1	P05305	212 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	GNS	P15586	552 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRI-208	ENST00000488015	WAS	P42768	502 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms