RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486196.1

CAPS2-208, Transcript of calcyphosine 2, human

TSL 4

Gene CAPS2, Length 595 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPS2-208	ENST00000486196	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	MYH4	Q9Y623	1939 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ERICH2	A1L162	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ACKR2	O00590	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ZBTB43	O43298	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SOAT2	O75908	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SGPL1	O95470	568 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SLC4A1	P02730	911 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	CCDC175	P0C221	793 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	STMN1	P16949	149 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	IL11	P20809	199 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	MMP13	P45452	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	NDUFV1	P49821	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	CDC16	Q13042	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	RAB39A	Q14964	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	WTAP	Q15007	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ALX1	Q15699	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	TBCC	Q15814	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	NLRP14	Q86W24	1093 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	KRT23	Q9C075	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	LY9	Q9HBG7	655 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196		A0A0B4J203	849 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SYCE3	A1L190	88 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196		E9PLN8	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196		H3BNC9	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	F2RL2	O00254	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SYT5	O00445	386 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SLC7A4	O43246	635 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	ECE2	O60344	883 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SLC22A3	O75751	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	NXPH3	O95157	252 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	NEFH	P12036	1026 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	CKMT1A	P12532	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	GZMA	P12544	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	SKIL	P12757	684 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	IL1R1	P14778	569 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	JUP	P14923	745 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	DPEP1	P16444	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CAPS2-208	ENST00000486196	HDC	P19113	662 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms