RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	KRT10	P13645	584 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	CR2	P20023	1033 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TGM2	P21980	687 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	CCNC	P24863	283 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ITGB7	P26010	798 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PTGER3	P43115	390 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RGR	P47804	291 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	CSNK1D	P48730	415 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ADPRH	P54922	357 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RWDD2B	P57060	319 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RAD51	Q06609	339 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF33A	Q06730	810 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ADCY2	Q08462	1091 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	CNTN1	Q12860	1018 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MYLK3	Q32MK0	819 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ARSI	Q5FYB1	569 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	BBS12	Q6ZW61	710 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	FAM124A	Q86V42	546 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TEX26	Q8N6G2	289 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RUBCN	Q92622	972 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	FOXJ1	Q92949	421 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ARRDC3	Q96B67	414 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	HES6	Q96HZ4	224 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	EXOC2	Q96KP1	924 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	OMD	Q99983	421 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MGME1	Q9BQP7	344 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	GPR174	Q9BXC1	333 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	HDAC8	Q9BY41	377 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	NCDN	Q9UBB6	729 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		9.62	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TSPAN11	A1L157	253 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	KRIT1	O00522	736 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	CST8	O60676	142 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	LRP3	O75074	770 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	GK	P32189	559 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	HOXD12	P35452	270 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MPL	P40238	635 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	DPP6	P42658	865 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MMP13	P45452	471 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MAPK8	P45983	427 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	NR2C2	P49116	596 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RENBP	P51606	427 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	NEK3	P51956	506 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	AP1S1	P61966	158 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	DYNLT1	P63172	113 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF235	Q14590	738 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	GRM3	Q14832	879 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PDK1	Q15118	436 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	MARC1	Q5VT66	337 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	NPNT	Q6UXI9	565 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	BBS5	Q8N3I7	341 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PGBD5	Q8N414	524 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	GANC	Q8TET4	914 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	DYRK4	Q9NR20	520 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	AMACR	Q9UHK6	382 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SFI1-222	ENST00000478887	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87

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