RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477197.1

WDR48-209, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 4

Gene WDR48, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-209ENST00000477197 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 SNX15Q9NRS6 342 aa5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 TAS2R10Q9NYW0 307 aa5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 EXTL2Q9UBQ6 330 aa5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 HSF4Q9ULV5 492 aa5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 AURKCQ9UQB9 309 aa5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 JRKLQ9Y4A0 524 aa5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 POMT1Q9Y6A1 747 aa5.86□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 TMEM191CA6NGB0 347 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 H0YIZ8 118 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 RNF103O00237 685 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 RTN2O75298 545 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 PMPCBO75439 489 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 WDR47O94967 919 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 F9P00740 461 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 IFNB1P01574 187 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 ANXA6P08133 673 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 CNPP09543 421 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 TSPY4P0CV99 314 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 TSPY10P0CW01 314 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 NEFHP12036 1026 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 IL10P22301 178 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 PROZP22891 400 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 KELP23276 732 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 MCM5P33992 734 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 HNMTP50135 292 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 ZXDAP98168 799 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 E2F1Q01094 437 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 RALGDSQ12967 914 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 ZBTB17Q13105 803 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 CAMK2DQ13557 499 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 ST3GAL2Q16842 350 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 BOLA3Q53S33 107 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 ERMARDQ5T6L9 678 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 LCE1DQ5T752 114 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 SPATA20Q8TB22 786 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 METTL6Q8TCB7 284 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 FAM162AQ96A26 154 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 C3orf49Q96BT1 292 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 VPS50Q96JG6 964 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 C1orf74Q96LT6 269 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 TEX12Q9BXU0 123 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 KLHL4Q9C0H6 718 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 MUC13Q9H3R2 512 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 SELENONQ9NZV5 590 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 DERAQ9Y315 318 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.85□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 KAT6AQ92794 2004 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 A0A0G2JPF8 293 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 J3KTA2 159 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 PEX11AO75192 247 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 E2F6O75461 281 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 TAF5LO75529 589 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 CSPG5O95196 566 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 CCNDBP1O95273 360 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 HMOX1P09601 288 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 UBL4AP11441 157 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 CD19P15391 556 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 SAT1P21673 171 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 DRD4P21917 467 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 TM4SF1P30408 202 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 HDAC4P56524 1084 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 CYP4A11Q02928 519 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 TNFAIP1Q13829 316 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 TRIM60Q495X7 471 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 KRBOX4Q5JUW0 171 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.84□□□□□ -1.47
WDR48-209ENST00000477197 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms