RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 P3H2Q8IVL5 708 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 FANCBQ8NB91 859 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 GTF2H4Q92759 462 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 UFD1Q92890 307 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 YIPF5Q969M3 257 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 AGAP4Q96P64 663 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ASB2Q96Q27 587 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 NANOGQ9H9S0 305 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF186Q9NXI6 227 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CNTN3Q9P232 1028 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 COPG2Q9UBF2 871 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 MED16Q9Y2X0 877 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 SNED1Q8TER0 1413 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 C2orf72A6NCS6 295 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 USP17L3A6NCW0 530 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 USP17L4A6NCW7 530 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 K7ENM7 598 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 APOL3O95236 402 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 STARD3NLO95772 234 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 DLGAP3O95886 979 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 APOA1P02647 267 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 BMP1P13497 986 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CPB1P15086 417 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CYP11B1P15538 503 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CREB1P16220 341 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 UQCRC1P31930 480 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 IL12RB1P42701 662 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CAPZA2P47755 286 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 PCP4P48539 62 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 POU3F4P49335 361 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 DGKQP52824 942 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 COTL1Q14019 142 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CCNIQ14094 377 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ERV3-1Q14264 604 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 LTB4RQ15722 352 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 LYPD8Q6UX82 237 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 USP51Q70EK9 711 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 KBTBD6Q86V97 674 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 METTL13Q8N6R0 699 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 BEST2Q8NFU1 509 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ART4Q93070 314 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC39Q96DD0 335 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 FEM1CQ96JP0 617 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ASB16Q96NS5 453 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNK16Q96T55 309 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 BRD7Q9NPI1 651 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP8B3O60423 1300 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A0D9SFI3 127 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms