RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GOLGA3	Q08378	1498 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378		H7C1Q1	480 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	UBE2C	O00762	179 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CTDSP2	O14595	271 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	USP12	O75317	370 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	HEXA	P06865	529 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	HOXB5	P09067	269 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM11	P17152	192 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC15A1	P46059	708 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ARSF	P54793	590 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	UBXN2A	P68543	259 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	KRT83	P78385	493 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	OLIG2	Q13516	323 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TXNDC8	Q6A555	127 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SCML4	Q8N228	414 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	EXD3	Q8N9H8	876 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SGCD	Q92629	289 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	COQ10A	Q96MF6	247 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	NLK	Q9UBE8	527 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	KAT6A	Q92794	2004 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1W2PQF6	199 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GLOD5	A6NK44	160 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	BTBD18	B2RXH4	712 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TP73	O15350	636 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ADAM20	O43506	726 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	DDAH2	O95865	285 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CYP2D6	P10635	497 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PCNA	P12004	261 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PTPN2	P17706	415 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TNFRSF1A	P19438	455 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TACR3	P29371	465 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CDA	P32320	146 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PTGER1	P34995	402 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CAPZA2	P47755	286 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	EFNA5	P52803	228 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	MFAP4	P55083	255 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ZBTB16	Q05516	673 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TUBA3C	Q13748	450 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PLK5	Q496M5	336 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	APPL2	Q8NEU8	664 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	FAR1	Q8WVX9	515 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC9A6	Q92581	669 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	C8orf49	Q96NF6	230 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	BBS4	Q96RK4	519 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	AOX1	Q06278	1338 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	CLGN	O14967	610 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	HS6ST1	O60243	411 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC25A12	O75746	678 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	NFATC1	O95644	943 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ESRRB	O95718	433 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GABRB1	P18505	474 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	YWHAQ	P27348	245 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	IDUA	P35475	653 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PIK3CA	P42336	1068 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	HSD17B4	P51659	736 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	F2RL1	P55085	397 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PSMC6	P62333	389 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TAP1	Q03518	808 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	PLP2	Q04941	152 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	MTA1	Q13330	715 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	TNFAIP1	Q13829	316 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	RUNX2	Q13950	521 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	KYNU	Q16719	465 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	ME3	Q16798	604 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RBBP4-208	ENST00000463378	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		6.22	□□□□□ -1.41

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