RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-208ENST00000462602 COL4A3Q01955 1670 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 EYSQ5T1H1 3165 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SHISA7A6NL88 538 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 WASH3PC4AMC7 463 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 E7EVH7 732 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SMAPO00193 183 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 STK25O00506 426 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 EPHX1P07099 455 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 COL4A2P08572 1712 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CHRNB1P11230 501 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CR2P20023 1033 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CD72P21854 359 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMB4P28070 264 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 IL12RB1P42701 662 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 LMAN1P49257 510 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS41P49754 854 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 DSC2Q02487 901 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MPP3Q13368 585 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 STARD3Q14849 445 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 UBXN2BQ14CS0 331 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MYLK3Q32MK0 819 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf27AQ580R0 203 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 EOGTQ5NDL2 527 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TEX35Q5T0J7 233 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZVU0 165 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 DSG4Q86SJ6 1040 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SRLQ86TD4 932 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 GLIS1Q8NBF1 620 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 UBXN4Q92575 508 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPRN2Q92932 1015 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 FBRSQ9HAH7 460 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 LMAN1LQ9HAT1 526 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 HCN2Q9UL51 889 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM170BA6NMN3 283 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MUSKO15146 869 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ALOX15BO15296 676 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 DCXO43602 365 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 BNIP3LO60238 219 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ATG13O75143 517 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF40O75150 1001 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 METTL18O95568 372 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 RHOXF2BP0C7M4 288 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ALADP13716 330 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 HLA-EP13747 358 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ITIH2P19823 946 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PRKCHP24723 683 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SERPINA4P29622 427 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CD86P42081 329 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 RGRP47804 291 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SKOR1P84550 965 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CDK16Q00536 496 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC7A5Q01650 507 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 GUCY2DQ02846 1103 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 BCL2L1Q07817 233 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CALCOCO2Q13137 446 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SEMA5AQ13591 1074 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 DUPD1Q68J44 220 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 IFT20Q8IY31 132 aa9.51□□□□□ -0.89
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