RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 GALNT7Q86SF2 657 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 KCNMB4Q86W47 210 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CEP57Q86XR8 500 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 TCEAL8Q8IYN2 117 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFAF2Q8N183 169 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 DCLK2Q8N568 766 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC63Q8NA47 563 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 RFWD2Q8NHY2 731 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF461Q8TAF7 563 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC8CQ8TDW0 803 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 USP33Q8TEY7 942 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 PPM1EQ8WY54 764 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ATP2A3Q93084 1043 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 RNF34Q969K3 372 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 WBP2Q969T9 261 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 VOPP1Q96AW1 172 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 SKA1Q96BD8 255 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF599Q96NL3 588 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 GPR78Q96P69 363 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 AGAP2Q99490 1192 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 APOL2Q9BQE5 337 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 MECRQ9BV79 373 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC3Q9BY71 257 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 PITPNM3Q9BZ71 974 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 C20orf27Q9GZN8 174 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 RNF208Q9H0X6 261 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 TLE6Q9H808 572 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 PCMTD2Q9NV79 361 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 UBP1Q9NZI7 540 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 GGT7Q9UJ14 662 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 MAFFQ9ULX9 164 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 YIPF1Q9Y548 306 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 OR51B4Q9Y5P0 310 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 IKBKGQ9Y6K9 419 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 USH1CQ9Y6N9 552 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 DOCK6Q96HP0 2047 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 SLC12A8A0AV02 714 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM43BA6NCK2 446 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 G3V2L1 256 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 MGRN1O60291 552 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 GLRA3O75311 464 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ZMPSTE24O75844 475 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 LATS1O95835 1130 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CD160O95971 181 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 EPOP01588 193 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CLTBP09497 229 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 TPH1P17752 444 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 SPRP35270 261 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 GMPRP36959 345 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ACVRL1P37023 503 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CHRNA4P43681 627 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 GJA8P48165 433 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 POLD2P49005 469 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 TUFMP49411 452 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 HARS2P49590 506 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 NUMBP49757 651 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINB8P50452 374 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 RENBPP51606 427 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 SGSHP51688 502 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 IKBKEQ14164 716 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 PRPSAP1Q14558 356 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC26Q2I0M4 334 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ANO4Q32M45 955 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 MGAT5BQ3V5L5 792 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 PPM1JQ5JR12 505 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 TMCO4Q5TGY1 634 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 PDPK2PQ6A1A2 396 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CASC4Q6P4E1 433 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 LILRA6Q6PI73 481 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CHST9Q7L1S5 443 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 MAVSQ7Z434 540 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms