RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 RTKNQ9BST9 563 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 IL36AQ9UHA7 158 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GGT7Q9UJ14 662 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SCML1Q9UN30 329 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 LRP4O75096 1905 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GTW7 788 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PPC4 97 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D3LB9A6J9 549 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO1FO00160 1098 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ALOX15BO15296 676 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 AKR1B10O60218 316 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEF11O60813 436 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PROSCO94903 275 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP3K6O95382 1288 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGNO95427 931 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PEX11BO96011 259 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TPM3P06753 285 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM253P0C7T8 217 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D3HP0C7X1 549 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CD59P13987 128 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 FECHP22830 423 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CD27P26842 260 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGEF1-206ENST00000461017 HCAR3P49019 387 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 DPYSL3Q14195 570 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGEF1-206ENST00000461017 KIF19Q2TAC6 998 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MYLK3Q32MK0 819 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC73Q5JTD7 316 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGEF1-206ENST00000461017 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGEF1-206ENST00000461017 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PGBD5Q8N414 524 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 MINDY1Q8N5J2 469 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TMIEQ8NEW7 156 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2T34Q8NGX1 318 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP76Q8TAP6 659 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 RAPGEF5Q92565 580 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGEF1-206ENST00000461017 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP44Q9C0F1 390 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLPH3Q9H4A6 298 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 FZD3Q9NPG1 666 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 FZD4Q9ULV1 537 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ITM2BQ9Y287 266 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 FADS3Q9Y5Q0 445 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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