RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 LHX3Q9UBR4 397 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 DFFAO00273 331 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC31A1O15431 190 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 RARAP10276 462 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 CEACAM1P13688 526 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 AMPD1P23109 780 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 CD38P28907 300 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM14Q14142 442 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 IL27RAQ6UWB1 636 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM69Q86WT6 500 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 NAXDQ8IW45 347 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP1R16AQ96I34 528 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 KLHL32Q96NJ5 620 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 HDAC8Q9BY41 377 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 PREBQ9HCU5 417 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 GGT7Q9UJ14 662 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 ITM2BQ9Y287 266 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 VILLO15195 856 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 MFAP3LO75121 409 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 ADRB3P13945 408 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 SPINK2P20155 84 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 ITGB7P26010 798 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 HTR7P34969 479 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 ABL2P42684 1182 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 NEK3P51956 506 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 NDST2P52849 883 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 FOXC1Q12948 553 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 DPYSQ14117 519 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 DEF6Q9H4E7 631 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 CAAP1Q9H8G2 361 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 PDFQ9HBH1 243 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 BTBD3Q9Y2F9 522 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-208ENST00000459627 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 C16orf96A6NNT2 1141 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 UPK3BL1B0FP48 263 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 UPK3BL2E5RIL1 263 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 ITIH2P19823 946 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC18A3Q16572 532 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF284Q2VY69 593 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 FBXL19Q6PCT2 694 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 HORMAD1Q86X24 394 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 FADS3Q9Y5Q0 445 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 PCNX2A6NKB5 2137 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGAP42A6NI28 874 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 H3BRJ5 948 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 MYO1FO00160 1098 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 PRAMEF11O60813 436 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 PIGNO95427 931 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 POP4O95707 220 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 IGSF6O95976 241 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 PMLP29590 882 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 RGRP47804 291 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 MMRN1Q13201 1228 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC14A1Q13336 389 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 ACAP1Q15027 740 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 DPYSL2Q16555 572 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF423Q2M1K9 1284 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 AFMIDQ63HM1 303 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 POLNQ7Z5Q5 900 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 PLPP6Q8IY26 295 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM5Q9C035 493 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 AKR1B10O60218 316 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 CD48P09326 243 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TPM1P09493 284 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 CLDN2P57739 230 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 BOLA3Q53S33 107 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF805Q5CZA5 627 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 GDPD4Q6W3E5 623 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-208ENST00000459627 GATAD2AQ86YP4 633 aa24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms