RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 CCR3P51677 355 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NUBP1P53384 320 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 AP1S1P61966 158 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF234Q14588 700 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 KCNJ11Q14654 390 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 STARD3Q14849 445 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DUPD1Q68J44 220 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 KCTD11Q693B1 232 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 C4orf22Q6V702 233 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 LEKR1Q6ZMV7 388 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CHPFQ8IZ52 775 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC89Q8N998 374 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PTPRN2Q92932 1015 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CLDN23Q96B33 292 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PRRX2Q99811 253 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CEP41Q9BYV8 373 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 GLOD4Q9HC38 313 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 VPS45Q9NRW7 570 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TSPAN11A1L157 253 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TTC34A8MYJ7 566 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ALOX15BO15296 676 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FZD6O60353 706 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ADAM23O75077 832 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 GJB3O75712 270 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ALDH1A2O94788 518 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SUN1O94901 812 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 KRT14P02533 472 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ETS1P14921 441 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NFKB1P19838 968 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CES1P23141 567 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PRKCHP24723 683 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PSMB4P28070 264 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 AVPR2P30518 371 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NTSR1P30989 418 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ADRA1AP35348 466 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MAPK8P45983 427 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NUMBP49757 651 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TUBB4BP68371 445 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SKOR1P84550 965 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF235Q14590 738 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DLG2Q15700 870 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PARP6Q2NL67 630 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 C8orf74Q6P047 294 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 KDELC1Q6UW63 502 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 BBS5Q8N3I7 341 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NSMCE1Q8WV22 266 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM131CQ96AQ9 280 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ECHDC3Q96DC8 303 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC114Q96M63 670 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 AGAP3Q96P47 875 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIB3Q96RU7 358 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ACOX2Q99424 681 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ERP44Q9BS26 406 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 NT5MQ9NPB1 228 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 GRHL1Q9NZI5 618 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1W2PQF6 199 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms