RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa21.41■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 FAM174AQ8TBP5 190 aa21.41■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.41■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 FEM1CQ96JP0 617 aa21.41■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 ISCUQ9H1K1 167 aa21.41■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.41■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.41■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.41■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 WASF3Q9UPY6 502 aa21.41■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 AP1G1O43747 822 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 TMCC1O94876 653 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 ITGAVP06756 1048 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 NDST2P52849 883 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 RHOAP61586 193 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 SERINC3Q13530 473 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 MYLK3Q32MK0 819 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 ZNF805Q5CZA5 627 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 HMCESQ96FZ2 354 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 IFNKQ9P0W0 207 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.4■■□□□ 1.02
LTB-211ENST00000446745 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 NEMP1O14524 444 aa21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 WNT9AO14904 365 aa21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 SLC31A1O15431 190 aa21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 MIPP30301 263 aa21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 IL9RQ01113 521 aa21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 ST3GAL2Q16842 350 aa21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 ZNF284Q2VY69 593 aa21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 FTSJ1Q9UET6 329 aa21.39■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 CBFA2T2O43439 604 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 TNFSF14O43557 240 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 TSPAN6O43657 245 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 PRLRP16471 622 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 SPINK2P20155 84 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 PCK1P35558 622 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 RXRGP48443 463 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 GRM3Q14832 879 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 NFKBIBQ15653 356 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 HGSNATQ68CP4 663 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 OR6K2Q8NGY2 324 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 ZWILCHQ9H900 591 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 BTBD3Q9Y2F9 522 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 MSRB2Q9Y3D2 182 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 TRPM6Q9BX84 2022 aa21.38■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 TMEM8BA6NDV4 472 aa21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 UGT2B4P06133 528 aa21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 SGCGQ13326 291 aa21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 TMEM259Q4ZIN3 620 aa21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 GDPD4Q6W3E5 623 aa21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 RFX8Q6ZV50 586 aa21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 TMEM145Q8NBT3 493 aa21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 KLK6Q92876 244 aa21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 LRRC19Q9H756 370 aa21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 FADS3Q9Y5Q0 445 aa21.37■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 DOCK9Q9BZ29 2069 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 H3BRJ5 948 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 LRCH4O75427 683 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 PROS1P07225 676 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 TPM1P09493 284 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 THEGLP0DJG4 465 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 ARL4AP40617 200 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 HCAR3P49019 387 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 TRIM14Q14142 442 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 BOLA3Q53S33 107 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 SAP25Q8TEE9 199 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 KLHL32Q96NJ5 620 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 PEBP4Q96S96 227 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 MYOCQ99972 504 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 TRIM7Q9C029 511 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 IP6K2Q9UHH9 426 aa21.36■■□□□ 1.01
LTB-211ENST00000446745 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms