RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 RTN2O75298 545 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 PAGE1O75459 146 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 PDGFRAP16234 1089 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 DGKAP23743 735 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 SDC4P31431 198 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 STK19P49842 368 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.51e-8■■■□□ 14.6
PRAME-210ENST00000442481 CNTN1Q12860 1018 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 AGBL4Q5VU57 503 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 ZSCAN30Q86W11 494 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 FAM131BQ86XD5 332 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 APCDD1Q8J025 514 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 JOSD2Q8TAC2 188 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R16AQ96I34 528 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 TMEM59LQ9UK28 342 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 VANGL2Q9ULK5 521 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 PPM1HQ9ULR3 514 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 SNX10Q9Y5X0 201 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 HS3ST4Q9Y661 456 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 SPTA1P02549 2419 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 MGAQ8IWI9 3026 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 TRIM38O00635 465 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 USP12O75317 370 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 F9P00740 461 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 PRNPP04156 253 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 KRT3P12035 628 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 KRT83P78385 493 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 VAC14Q08AM6 782 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 BRMS1LQ5PSV4 323 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 TRNP1Q6NT89 227 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 IGF2-ASQ6U949 168 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 MON1BQ7L1V2 547 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 TMEM145Q8NBT3 493 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 WDR48Q8TAF3 677 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 FRS2Q8WU20 508 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 HIC2Q96JB3 615 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 MCEEQ96PE7 176 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 CALN1Q9BXU9 219 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 TMEM51Q9NW97 253 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 VPS28Q9UK41 221 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.91□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 ATMQ13315 3056 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 A6NNZ2 444 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 FFAR2O15552 330 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 KLK10O43240 276 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 SRGAP2O75044 1071 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 CSO75390 466 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 CLDN11O75508 207 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 PIAS2O75928 621 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 MPOP05164 745 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 C6P13671 934 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 GPD1P21695 349 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 RRM1P23921 792 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 CXCR3P49682 368 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 IRAK1P51617 712 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 CLCN6P51797 869 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 PTP4A2Q12974 167 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 DLG2Q15700 870 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP40Q5TG30 622 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 FBXL22Q6P050 247 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 LRRC31Q6UY01 552 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 C14orf80Q86SX3 495 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 HORMAD1Q86X24 394 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A45Q8N413 288 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 C3orf20Q8ND61 904 aa11.9□□□□□ -0.5
PRAME-210ENST00000442481 MAPK15Q8TD08 544 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms