RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 TAF5Q15542 800 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A45Q8N413 288 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SERPINB11Q96P15 392 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ACP6Q9NPH0 428 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 AK5Q9Y6K8 562 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.73□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 ISM2Q6H9L7 571 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CHSY1Q86X52 802 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ERICH1Q86X53 443 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SPATA20Q8TB22 786 aa6.73□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 NT5C1BQ96P26 610 aa6.73□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 YKT6O15498 198 aa6.72□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PLK1P53350 603 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TLE3Q04726 772 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.72□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 BEND5Q7L4P6 421 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 C14orf80Q86SX3 495 aa6.72□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 NOX5Q96PH1 765 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TSG101Q99816 390 aa6.72□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.72□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ST7Q9NRC1 585 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CEP83Q9Y592 693 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 U3KQA8 63 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 F5H5T6 163 aa6.72□□□□□ -1.33
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