RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 SLC22A12Q96S37 553 aa23.49■■□□□ 1.35
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FAAP20-209ENST00000428120 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 INSL5Q9Y5Q6 135 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 KCNA4P22459 653 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 GABRB3P28472 473 aa23.48■■□□□ 1.35
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FAAP20-209ENST00000428120 ZNF235Q14590 738 aa23.48■■□□□ 1.35
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FAAP20-209ENST00000428120 C5orf22Q49AR2 442 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 PLD4Q96BZ4 506 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ERP27Q96DN0 273 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 MCMBPQ9BTE3 642 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 MYLK2Q9H1R3 596 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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FAAP20-209ENST00000428120 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 SLC39A10Q9ULF5 831 aa23.48■■□□□ 1.35
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FAAP20-209ENST00000428120 H3BNC9 293 aa23.48■■□□□ 1.35
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FAAP20-209ENST00000428120 MTA1Q13330 715 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 GRM3Q14832 879 aa23.48■■□□□ 1.35
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FAAP20-209ENST00000428120 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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FAAP20-209ENST00000428120 PDFQ9HBH1 243 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 VPS45Q9NRW7 570 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ZBBXA8MT70 800 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 KLF11O14901 512 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 FBXW10Q5XX13 1052 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 C20orf27Q9GZN8 174 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ATP13A1Q9HD20 1204 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TREX1Q9NSU2 369 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 A0A096LPK6 155 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TIMM44O43615 452 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEA12P43365 314 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 CDH4P55283 916 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 NLRP9Q7RTR0 991 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 PNPLA1Q8N8W4 532 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC37BQ96QE4 947 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ALDH3A1P30838 453 aa23.46■■□□□ 1.35
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FAAP20-209ENST00000428120 ATG16L1Q676U5 607 aa23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TNS4Q8IZW8 715 aa23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ISL2Q96A47 359 aa23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ECT2Q9H8V3 914 aa23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ARNT2Q9HBZ2 717 aa23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 CHD5Q8TDI0 1954 aa23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 CCL22O00626 93 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 PROCP04070 461 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 C2P06681 752 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 GSTA1P08263 222 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 SLC1A2P43004 574 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 SETDB1Q15047 1291 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ADGRF1Q5T601 910 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TXNDC8Q6A555 127 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF470Q6ECI4 717 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TCEAL8Q8IYN2 117 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM199Q8N511 208 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 EXOC2Q96KP1 924 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-209ENST00000428120 CDH23Q9H251 3354 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 BIRC5O15392 142 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 AVPR1AP37288 418 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 BNIP1Q12981 228 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 PCLAFQ15004 111 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM42Q8IWZ5 723 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEH1Q9H213 219 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 RHOJQ9H4E5 214 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA0355O15063 1070 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 FGF18O76093 207 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 KITP10721 976 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 STXBP5Q5T5C0 1151 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-209ENST00000428120 RAPH1Q70E73 1250 aa23.44■■□□□ 1.34
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