RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 UFM1P61960 85 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 VEPH1Q14D04 833 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 SYTL3Q4VX76 610 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF667Q5HYK9 610 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 WDR78Q5VTH9 848 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 NUGGCQ68CJ6 796 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM81Q6P7N7 255 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 MOB3CQ70IA8 216 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 PRSS45Q7RTY3 260 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRC-208ENST00000427110 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
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PTPRC-208ENST00000427110 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRC-208ENST00000427110 SAAL1Q96ER3 474 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 ZFYVE19Q96K21 471 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 KLHL15Q96M94 604 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRC-208ENST00000427110 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 TAS2R10Q9NYW0 307 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRC-208ENST00000427110 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
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PTPRC-208ENST00000427110 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRC-208ENST00000427110 DPP6P42658 865 aa2.59□□□□□ -1.99
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PTPRC-208ENST00000427110 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa2.59□□□□□ -1.99
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PTPRC-208ENST00000427110 ASB5Q8WWX0 329 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 SLC25A28Q96A46 364 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-208ENST00000427110 TRMOQ9BU70 441 aa2.59□□□□□ -1.99
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