RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PTK2BQ14289 1009 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF484Q5JVG2 852 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM72AQ5TYM5 149 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SPRYD7Q5W111 196 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM72DQ6L9T8 149 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR142Q7Z601 462 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 UNC93AQ86WB7 457 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM72BQ86X60 149 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ADA2Q9NZK5 511 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 C9IYK1 514 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CSPG5O95196 566 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 VARSP26640 1264 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP107P57740 925 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GRM3Q14832 879 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD23Q86SG2 305 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 MYO1HQ8N1T3 1032 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 LZTR1Q8N653 840 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ASB9Q96DX5 294 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM165Q9HC07 324 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC36A6NLP5 189 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 BMP10O95393 424 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 FGFR3P22607 806 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TKTP29401 623 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SCNN1AP37088 669 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 AVPR1AP37288 418 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CD97P48960 835 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL34P49207 117 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKAA1Q13131 559 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SYPL2Q5VXT5 272 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 LIPMQ5VYY2 423 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT80Q6KB66 452 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC29A1Q99808 456 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 UBP1Q9NZI7 540 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 VTI1BQ9UEU0 232 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 M0QYT0 321 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PLOD2O00469 737 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TIMM44O43615 452 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SUPT3HO75486 399 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZYG11AQ6WRX3 759 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 DPP9Q86TI2 863 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PIGZQ86VD9 579 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 HM13Q8TCT9 377 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 STON2Q8WXE9 905 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 IL22Q9GZX6 179 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PIGVQ9NUD9 493 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF711Q9Y462 761 aa18.55■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM233B4DJY2 109 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 DCLK1O15075 740 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ACADSBP45954 432 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFV1P49821 464 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CDH15P55291 814 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PSME3P61289 254 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 C16orf72Q14CZ0 275 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 C2orf69Q8N8R5 385 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF169Q8NCN4 708 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 MCMBPQ9BTE3 642 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHAC1Q9H158 963 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CASS4Q9NQ75 786 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SETD4Q9NVD3 440 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 MID2Q9UJV3 735 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP205Q92621 2012 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TANC1Q9C0D5 1861 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SPTLC1O15269 473 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NMBRP28336 390 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 LAMC2Q13753 1193 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 KIZQ2M2Z5 673 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC44A4Q53GD3 710 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 MTX3Q5HYI7 312 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 C9orf57Q5W0N0 161 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CST9Q5W186 159 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 FIBCD1Q8N539 461 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa18.54■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD4Q8WVF5 259 aa18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms