RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 TADA1Q96BN2 335 aa17.18■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SEMA3CQ99985 751 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 GORASP1Q9BQQ3 440 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC40Q9H9A6 602 aa17.18■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ASB2Q96Q27 587 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NOD2Q9HC29 1040 aa17.16■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFU1Q9UMS0 254 aa17.16■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM63AO94886 807 aa17.15■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MLNP12872 115 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CARD16Q5EG05 197 aa17.15■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP128Q6ZU80 1094 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRLQ86TD4 932 aa17.15■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa17.15■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TM6SF2Q9BZW4 377 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBP1Q9NZI7 540 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7EQS6 105 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPFIA2O75334 1257 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 POP4O95707 220 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 BMP1P13497 986 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 CA4P22748 312 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRKCQQ04759 706 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAD51Q06609 339 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF234Q14588 700 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRD3Q15059 726 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 PON2Q15165 354 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXO43Q4G163 708 aa17.15■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
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