RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 AGKQ53H12 422 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 MBLAC2Q68D91 279 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 STRA8Q7Z7C7 330 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 HERC6Q8IVU3 1022 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 MARVELD2Q8N4S9 558 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 WNT8BQ93098 351 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 COX4I2Q96KJ9 171 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CCDC28BQ9BUN5 200 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CD247P20963 164 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 OXCT1P55809 520 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SEL1L3Q68CR1 1132 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 IFNL1Q8IU54 200 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 UBR7Q8N806 425 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SLC4A11Q8NBS3 891 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 LZICQ8WZA0 190 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ELMO1Q92556 727 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 STK39Q9UEW8 545 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CIDEBQ9UHD4 219 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CAPN15O75808 1086 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 H6PDO95479 791 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 JUNP05412 331 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 HMOX2P30519 316 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 THPOP40225 353 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 DNASE1L3Q13609 305 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 TFDP2Q14188 446 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PCLAFQ15004 111 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CA9Q16790 459 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 FUT11Q495W5 492 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 IQSEC1Q6DN90 963 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 NAPRTQ6XQN6 538 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 GAD1Q99259 594 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 AGAP2Q99490 1192 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SEPHS2Q99611 448 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 COPG2Q9UBF2 871 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 DNAJB4Q9UDY4 337 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 TLK1Q9UKI8 766 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CDY2AQ9Y6F7 541 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CDY1Q9Y6F8 540 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PARP14Q460N5 1801 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 A0A096LPK6 155 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 B4GAT1O43505 415 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SLC12A1Q13621 1099 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 GRM2Q14416 872 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 KIF19Q2TAC6 998 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CBR4Q8N4T8 237 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ARRDC4Q8NCT1 418 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM176AQ96HP8 235 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 FBXL20Q96IG2 436 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PAAF1Q9BRP4 392 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 DRC3Q9H069 523 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ING2Q9H160 280 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 RSAD1Q9HA92 442 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 FUOMA2VDF0 154 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ATE1O95260 518 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ESRRBO95718 433 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PAX3P23760 479 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CRHR1P34998 444 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PID1Q7Z2X4 250 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ISOC1Q96CN7 298 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PLEKHA8Q96JA3 519 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SLC45A3Q96JT2 553 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 EFCAB1Q9HAE3 211 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SPATA7Q9P0W8 599 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 PTP4A2Q12974 167 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SNX17Q15036 470 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 KIAA2013Q8IYS2 634 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 AHI1Q8N157 1196 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 OR9I1Q8NGQ6 314 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 CAPSLQ8WWF8 208 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 LPGAT1Q92604 370 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 SNX25Q9H3E2 840 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 FAIMQ9NVQ4 179 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 MORF4L1Q9UBU8 362 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 RAB26Q9ULW5 256 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 HMX2A2RU54 273 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 C17orf102A2RUQ5 167 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 E2F6O75461 281 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 FUCA1P04066 466 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 RBP5P82980 135 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 MGAT5BQ3V5L5 792 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRN-202ENST00000409251 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms