RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 TNFRSF8P28908 595 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SLC1A1P43005 524 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SELENOPP49908 381 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 RAB27AP51159 221 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 STARD6P59095 220 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 OSTNP61366 133 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 RBP5P82980 135 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 MAP9Q49MG5 647 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 XKR4Q5GH76 650 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 NAA35Q5VZE5 725 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 VASNQ6EMK4 673 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 C8orf74Q6P047 294 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 COG1Q8WTW3 980 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 MYADMQ96S97 322 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 MMS19Q96T76 1030 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 NUP85Q9BW27 656 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CHST12Q9NRB3 414 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 GINS2Q9Y248 185 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 LZTS1Q9Y250 596 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 F5P12259 2224 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ZNF185O15231 689 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ATP8B1O43520 1251 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PSTPIP1O43586 416 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SRGAP2O75044 1071 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 KCNK5O95279 499 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 FAHP16930 419 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CD58P19256 250 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CD72P21854 359 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 MMP8P22894 467 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CSRP2Q16527 193 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 GPR149Q86SP6 731 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 FAM228AQ86W67 206 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 C3orf20Q8ND61 904 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SGSM3Q96HU1 749 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 AJUBAQ96IF1 538 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 HPDLQ96IR7 371 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ZNF747Q9BV97 191 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 MIS12Q9H081 205 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 LHX5Q9H2C1 402 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ACP6Q9NPH0 428 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 DPP3Q9NY33 737 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PADI3Q9ULW8 664 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 IPPQ9Y573 584 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SQORQ9Y6N5 450 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CITO14578 2027 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 EVPLQ92817 2033 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CACNA1EQ15878 2313 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SPOPO43791 374 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 LRP3O75074 770 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 RPS6KA5O75582 802 aa6.81□□□□□ -1.32
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