RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406859.7

NRXN1-211, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NRXN1, Length 2,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-211ENST00000406859 TRAF2Q12933 501 aa7.31□□□□□ -1.24
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NRXN1-211ENST00000406859 PTPRNQ16849 979 aa7.31□□□□□ -1.24
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NRXN1-211ENST00000406859 CD300AQ9UGN4 299 aa7.31□□□□□ -1.24
NRXN1-211ENST00000406859 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.31□□□□□ -1.24
NRXN1-211ENST00000406859 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
NRXN1-211ENST00000406859 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.31□□□□□ -1.24
NRXN1-211ENST00000406859 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.31□□□□□ -1.24
NRXN1-211ENST00000406859 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.3□□□□□ -1.24
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