RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397070.6

TM2D2-201, Transcript of TM2 domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TM2D2, Length 1,631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2-201ENST00000397070 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 SPOCK2Q92563 424 aa18.48■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.48■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 SLC13A1Q9BZW2 595 aa18.48■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 TREX1Q9NSU2 369 aa18.48■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 SEPT3Q9UH03 358 aa18.48■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 DCDC2Q9UHG0 476 aa18.48■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 LZTS1Q9Y250 596 aa18.48■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa18.48■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 BIRC5O15392 142 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 LRG1P02750 347 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 CA8P35219 290 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 RNF43Q68DV7 783 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 IL31Q6EBC2 164 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 LILRA6Q6PI73 481 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 CCT6BQ92526 530 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 FEM1CQ96JP0 617 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 AGAP2Q99490 1192 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 MGME1Q9BQP7 344 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 TRPC7Q9HCX4 862 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 NOTCH4Q99466 2003 aa18.47■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 A0A0D9SEW6 157 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 WDR91A4D1P6 747 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 MPOP05164 745 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 GSTA1P08263 222 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 PFKLP17858 780 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 CHRNA4P43681 627 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 SGSHP51688 502 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 SEPT6Q14141 434 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 FYB2Q5VWT5 728 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 FAM217AQ8IXS0 508 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 ELMOD1Q8N336 334 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 DCLK2Q8N568 766 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 WBP2Q969T9 261 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 ZNF778Q96MU6 729 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 SEMA3CQ99985 751 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 FAM167BQ9BTA0 163 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 RHOJQ9H4E5 214 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 KLHL14Q9P2G3 628 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 IRAK3Q9Y616 596 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 MYOFQ9NZM1 2061 aa18.46■□□□□ 0.55
TM2D2-201ENST00000397070 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 CXCL14O95715 111 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 EPOP01588 193 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 FGF1P05230 155 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 NEFHP12036 1026 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 HLA-DPA1P20036 260 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 TYK2P29597 1187 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 POLD2P49005 469 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 LAMB3Q13751 1172 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 FSTL4Q6MZW2 842 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 Q6ZNB5 142 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 NLRP9Q7RTR0 991 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 OTOAQ7RTW8 1153 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 TMC8Q8IU68 726 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 SLC25A41Q8N5S1 370 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 CCDC63Q8NA47 563 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 ARMC2Q8NEN0 867 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 OR52K2Q8NGK3 314 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 ZNF398Q8TD17 642 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 BADQ92934 168 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 VPS39Q96JC1 886 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 PSKH2Q96QS6 385 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 GPR22Q99680 433 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 TSSK1BQ9BXA7 367 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 SNX15Q9NRS6 342 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 SMPD4Q9NXE4 827 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 SIRPGQ9P1W8 387 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 SCN8AQ9UQD0 1980 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 SERPINF2P08697 491 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 HDCP19113 662 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 CES1P23141 567 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 GABRR2P28476 465 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 CDC25CP30307 473 aa18.45■□□□□ 0.54
TM2D2-201ENST00000397070 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms