RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394744.6

RAB11FIP4-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 1,968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-201ENST00000394744 COPG2Q9UBF2 871 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.14■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MYLKQ15746 1914 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ITM2AO43736 263 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ACSL4O60488 711 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 AHSGP02765 367 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KRT16P08779 473 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZBTB16Q05516 673 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CTBP1Q13363 440 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CNGA3Q16281 694 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCDC153Q494R4 210 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 VWCEQ96DN2 955 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 VPS45Q9NRW7 570 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DNAJC6O75061 913 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MPP1Q00013 466 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TNK2Q07912 1038 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TOX2Q96NM4 488 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HAUS5O94927 633 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SAT1P21673 171 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HADHAP40939 763 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MTA1Q13330 715 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LBRQ14739 615 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TNS4Q8IZW8 715 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SAR1AQ9NR31 198 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 COL4A6Q14031 1691 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PRAMEF11O60813 436 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SERPINE1P05121 402 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CPA3P15088 417 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC1A6P48664 564 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CSRP3P50461 194 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PGGT1BP53609 377 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 AQP5P55064 265 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UGP2Q16851 508 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C5orf22Q49AR2 442 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HECTD3Q5T447 861 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TBX21Q9UL17 535 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HEATR9A2RTY3 570 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 COCHO43405 550 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SOD2P04179 222 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PAMP19021 973 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC1A2P43004 574 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RAPH1Q70E73 1250 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TADA1Q96BN2 335 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SIN3BO75182 1162 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GJB3O75712 270 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ABLIM3O94929 683 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RALBP11234 206 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CDK18Q07002 472 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TTC7BQ86TV6 843 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DENND1CQ8IV53 801 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 INPP5DQ92835 1189 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 A0A0D9SEW6 157 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FCHO1O14526 889 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MUSKO15146 869 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 AVPR1AP37288 418 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC11A2P49281 568 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ITGA9Q13797 1035 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms