RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 TEX44Q53QW1 395 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 SZRD1Q7Z422 152 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 GIPC2Q8TF65 315 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 APBB2Q92870 758 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FBXO32Q969P5 355 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ASIC4Q96FT7 647 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP2S1Q96SQ9 504 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 RBBP8Q99708 897 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CASS4Q9NQ75 786 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 HPS4Q9NQG7 708 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 IPPQ9Y573 584 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TIMM22Q9Y584 194 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM72CH0Y354 149 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 H0Y626 953 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 NCAM2O15394 837 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 PSMD3O43242 534 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM16O95361 564 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 WNT3AP56704 352 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 GALNT3Q14435 633 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 MRNIPQ6NTE8 343 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM72BQ86X60 149 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM47BQ8NA70 645 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 NRG4Q8WWG1 115 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 MYLPFQ96A32 169 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TINF2Q9BSI4 451 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TRHDEQ9UKU6 1024 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CXCL11O14625 94 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 NRP1O14786 923 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP3A5P20815 502 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 NR4A1P22736 598 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 EPHX2P34913 555 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 LHX1P48742 406 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 GALK1P51570 392 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 LIMK2P53671 638 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 PLCL1Q15111 1095 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 NR6A1Q15406 480 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 PCID2Q5JVF3 399 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 GPR158Q5T848 1215 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 STK32CQ86UX6 486 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CFAP52Q8N1V2 620 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 OR9I1Q8NGQ6 314 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ACOX2Q99424 681 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 RUBCNLQ9H714 662 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 GID8Q9NWU2 228 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 MAGEB16A2A368 324 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 F8W8V4 182 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 BTN3A1O00481 513 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TP73O15350 636 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FBXO21O94952 628 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 RBP1P09455 135 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ITGAXP20702 1163 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CES1P23141 567 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 PIK3CGP48736 1102 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 CLCNKBP51801 687 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 RIN3Q8TB24 985 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FIG4Q92562 907 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 LPGAT1Q92604 370 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 PCED1BQ96HM7 432 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 LRP5O75197 1615 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 BCORQ6W2J9 1755 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM159BA6NKW6 160 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 STBD1O95210 358 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 FKBP9O95302 570 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 HGFP14210 728 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD42-202ENST00000393389 PSEN2P49810 448 aa8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms