RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393119.6

MKS1-202, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-202ENST00000393119 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.18■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 PDFQ9HBH1 243 aa15.18■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 PCMTD2Q9NV79 361 aa15.18■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.18■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 FETUBQ9UGM5 382 aa15.18■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 GGT7Q9UJ14 662 aa15.18■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ACTL7BQ9Y614 415 aa15.18■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 MGRN1O60291 552 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 PRAMEF11O60813 436 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 RENBPP51606 427 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ZNF33AQ06730 810 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 DNAJC3Q13217 504 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 SEPT6Q14141 434 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 RASA2Q15283 850 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 DLG2Q15700 870 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 RANBP10Q6VN20 620 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 EP400NLQ6ZTU2 488 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CMC1Q7Z7K0 106 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 PTPRN2Q92932 1015 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 PLD4Q96BZ4 506 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 GALNT3Q14435 633 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 SLC5A9Q2M3M2 681 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 C5orf22Q49AR2 442 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CGB2Q6NT52 195 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 C16orf46Q6P387 395 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CCDC121Q6ZUS5 278 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 MECRQ9BV79 373 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ZNF358Q9NW07 568 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ZFATQ9P243 1243 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.17■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 LPXNO60711 386 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 RHOCP08134 193 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 TAC1P20366 129 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ARNTP27540 789 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CLCN4P51793 760 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 IL10RBQ08334 325 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CNGA3Q16281 694 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 PARP15Q460N3 678 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ZNF276Q8N554 614 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 HERVK_113Q902F9 699 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ATP13A1Q9HD20 1204 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 K7ERQ8 282 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 HGSO14964 777 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ANXA9O76027 345 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 VAPBO95292 243 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CD160O95971 181 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 GLUD1P00367 558 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 MT-CO1P00395 513 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ADH1AP07327 375 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CA3P07451 260 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 PBX2P40425 430 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 MAPKAPK2P49137 400 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CDH4P55283 916 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 SATB1Q01826 763 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 NR1H3Q13133 447 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CTBP1Q13363 440 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ANO4Q32M45 955 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 TEX26Q8N6G2 289 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 CCT6BQ92526 530 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 TTC17Q96AE7 1141 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 MUC3BQ9H195 1237 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 SOX13Q9UN79 622 aa15.16■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 TPP1O14773 563 aa15.15■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 AURKAO14965 403 aa15.15■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 C1RP00736 705 aa15.15■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 SCTRP47872 440 aa15.15■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 GEMP55040 296 aa15.15■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ARF5P84085 180 aa15.15■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 MGAT5Q09328 741 aa15.15■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 STRA8Q7Z7C7 330 aa15.15■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 KCNMB4Q86W47 210 aa15.15■□□□□ 0.02
MKS1-202ENST00000393119 MYLIPQ8WY64 445 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms