RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 PLPP6Q8IY26 295 aa15.17■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa15.17■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 SLC6A18Q96N87 628 aa15.17■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 PANX2Q96RD6 677 aa15.17■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM9BQ9NQ34 198 aa15.17■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 INTUQ9ULD6 942 aa15.17■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 CACNA1EQ15878 2313 aa15.17■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 A0A1B0GVT2 93 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 A0A1W2PPC4 97 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 KRIT1O00522 736 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 ARHGAP33O14559 1287 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 WNT9AO14904 365 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 INSIG1O15503 277 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 LCA5LO95447 670 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 UGT2B4P06133 528 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 ITGB7P26010 798 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 MAGEA1P43355 309 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 RGRP47804 291 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 CCR5P51681 352 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 MYLK3Q32MK0 819 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC170Q8IYT3 715 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 MINDY1Q8N5J2 469 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 LZTR1Q8N653 840 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 PPP1R16AQ96I34 528 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 HDAC8Q9BY41 377 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 SP110Q9HB58 689 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 DYRK4Q9NR20 520 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.16■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 TM4SF5O14894 197 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 LATO43561 262 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 MFSD11O43934 449 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 IGSF6O95976 241 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 SDHBP21912 280 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 ARHGAP25P42331 645 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 ABL2P42684 1182 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 NEK3P51956 506 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 TCEAL1Q15170 157 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 UAP1L1Q3KQV9 507 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 RAD9BQ6WBX8 426 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 SPC24Q8NBT2 197 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 RAPGEF5Q92565 580 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 KDM4CQ9H3R0 1056 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 GOLPH3Q9H4A6 298 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 PREBQ9HCU5 417 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa15.15■□□□□ 0.02
CSAG1-202ENST00000370287 RCCD1A6NED2 376 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 MUSKO15146 869 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 GJB3O75712 270 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 PIGNO95427 931 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 PEX11BO96011 259 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 WNT1P04628 370 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 SYPP08247 313 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 KRT7P08729 469 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 ADRB3P13945 408 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 CDC25BP30305 580 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 IL10RBQ08334 325 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 LRRC73Q5JTD7 316 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 TRIM69Q86WT6 500 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM139Q8IV31 216 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 KCTD6Q8NC69 237 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 KLK6Q92876 244 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 FAF2Q96CS3 445 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF670Q9BS34 389 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 CALN1Q9BXU9 219 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 IL21RQ9HBE5 538 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 GGT7Q9UJ14 662 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 ITM2BQ9Y287 266 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 FADS3Q9Y5Q0 445 aa15.14■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 DOCK9Q9BZ29 2069 aa15.13■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 A0A1W2PQU0 124 aa15.13■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.13■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 SPINT1O43278 529 aa15.13■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 MAFKO60675 156 aa15.13■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 PALMO75781 387 aa15.13■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 NDUFA10O95299 355 aa15.13■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 MAP3K6O95382 1288 aa15.13■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 SERPINB6P35237 376 aa15.13■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 GRIA4P48058 902 aa15.13■□□□□ 0.01
CSAG1-202ENST00000370287 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms