RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 WWOXQ9NZC7 414 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNPY2Q9Y2B0 182 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 C4orf47A7E2U8 309 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITM2AO43736 263 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPAN3O60637 253 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOX30O94993 753 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAGAP17050 411 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTPS1P17812 591 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCTDP32321 178 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARSFP54793 590 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC12A1Q13621 1099 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 SHBQ15464 509 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASIC2Q16515 512 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC18A3Q16572 532 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 FJX1Q86VR8 437 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBFAQ8N0V3 343 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR14A16Q8NHC5 309 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMAN2LQ9H0V9 348 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 MROH8Q9H579 483 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD93Q9NPY3 652 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRP12Q9Y561 859 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PER2O15055 1255 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A17O43808 307 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLUD1P00367 558 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHRM4P08173 479 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMTP48728 403 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLUD2P49448 558 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC18A2Q05940 514 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM27E3Q08E93 113 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAF2Q12933 501 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPFIA1Q13136 1202 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYBPC2Q14324 1141 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLCB4Q15147 1175 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 HLFQ16534 295 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHD1LQ86WJ1 897 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZMIZ2Q8NF64 920 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 STAMQ92783 540 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF183Q96D59 192 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD180Q99467 661 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 REEP2Q9BRK0 252 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TM6SF1Q9BZW5 370 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPHX3Q9H6B9 360 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALKBH4Q9NXW9 302 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM90A7PA6NKC0 464 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM90A22PA8MWA6 464 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM90A12PA8MX19 464 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHL1O00533 1208 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP104O60308 925 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CENPAP49450 140 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 DSCR9P59020 149 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE3AQ05086 875 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAPSQ13938 189 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 KEAP1Q14145 624 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAA25Q14CX7 972 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATG16L1Q676U5 607 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 NADSYN1Q6IA69 706 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 MON1AQ86VX9 555 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPXM2Q8N436 756 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPT2Q8TD30 523 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM216AQ8WUB2 273 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCLT1Q96NL6 688 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTAGE1Q96RT6 745 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC32A1Q9H598 525 aa3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms