RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.6■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 NRF1Q16656 503 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 DSELQ8IZU8 1212 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 OR10G6Q8NH81 332 aa22.6■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 REEP1Q9H902 201 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 OR10H2O60403 315 aa22.6■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 FAM187BQ17R55 369 aa22.6■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A23Q9BV35 468 aa22.6■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 H3BMM5 538 aa22.59■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 USP41Q3LFD5 358 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H2ACQ93077 130 aa22.59■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 CYLDQ9NQC7 956 aa22.59■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.59■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 HOXC6P09630 235 aa22.59■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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PTPRM-201ENST00000332175 KCTD4Q8WVF5 259 aa22.58■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.57■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 TAF5Q15542 800 aa22.57■■□□□ 1.2
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PTPRM-201ENST00000332175 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 PACSIN3Q9UKS6 424 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 OR10H1Q9Y4A9 318 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRM-201ENST00000332175 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.57■■□□□ 1.2
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