RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316786.1

C9orf106-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 106 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf106, Length 3,145 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106-201ENST00000316786 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 IGSF9Q9P2J2 1179 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 IKBKGQ9Y6K9 419 aa13.45□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 SLC12A8A0AV02 714 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 FAM47DPA6NHR8 397 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 ARHGAP42A6NI28 874 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 TLR5O60602 858 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CNTN5O94779 1100 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CA4P22748 312 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CCNG1P51959 295 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 WDR4P57081 412 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 ALFQ53S48 1182 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 MS4A13Q5J8X5 152 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 ATPAF2Q8N5M1 289 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 SPATA22Q8NHS9 363 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 MZB1Q8WU39 189 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 SLC44A1Q8WWI5 657 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 ARNTL2Q8WYA1 636 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CLSTN3Q9BQT9 956 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 SYBUQ9NX95 663 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 DOLKQ9UPQ8 538 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 SEC24AO95486 1093 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CSH1P0DML2 217 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CSH2P0DML3 217 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 STX2P32856 288 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 RXRGP48443 463 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 RAP1GAP2Q684P5 730 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 SLC8B1Q6J4K2 584 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 MSANTD2Q6P1R3 559 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 DPF3Q92784 378 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 TOP1MTQ969P6 601 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 MYEOVQ96EZ4 313 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 SAMD15Q9P1V8 674 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 MTRRQ9UBK8 725 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CCDC160A6NGH7 325 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 SLC38A8A6NNN8 435 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 TCP11X1B4DZS4 312 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 F7P08709 466 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 DRD4P21917 467 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 KCNQ1P51787 676 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 TUBA1BP68363 451 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 BMPR2Q13873 1038 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 FAM209AQ5JX71 171 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 TUBA1AQ71U36 451 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 LRRC6Q86X45 466 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 VPS37AQ8NEZ2 397 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 ACTL7BQ9Y614 415 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 COL4A6Q14031 1691 aa13.44□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 MAFKO60675 156 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 PARNO95453 639 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 ASMTLO95671 621 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CCNB1P14635 433 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 TPH1P17752 444 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 HOXC13P31276 330 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 RALGDSQ12967 914 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 SLC1A5Q15758 541 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 OTOP2Q7RTS6 562 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 DNAAF3Q8N9W5 541 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 GSDMBQ8TAX9 411 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 IGSF8Q969P0 613 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 HSPBAP1Q96EW2 488 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 SERAC1Q96JX3 654 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 TEKT5Q96M29 485 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 NUDCD1Q96RS6 583 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CENPKQ9BS16 269 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 GBA3Q9H227 469 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 TRPC7Q9HCX4 862 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CLIC5Q9NZA1 410 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 PDP2Q9P2J9 529 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 GRID1Q9ULK0 1009 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 RAD54BQ9Y620 910 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CCDC78A2IDD5 438 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 SDR42E2A6NKP2 422 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 ACADSP16219 412 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 CALB2P22676 271 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 NCALDP61601 193 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 TMTC4Q5T4D3 741 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 SPOCK2Q92563 424 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 LRRC39Q96DD0 335 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM169Q96HH4 297 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 FETUBQ9UGM5 382 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 MYO7AQ13402 2215 aa13.43□□□□□ -0.26
C9orf106-201ENST00000316786 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms