RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A41Q8N5S1 370 aa27.16■■□□□ 1.94
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HOXD8-201ENST00000313173 MCMBPQ9BTE3 642 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ZBED2Q9BTP6 218 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 GLRA3O75311 464 aa27.15■■□□□ 1.94
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HOXD8-201ENST00000313173 TREX1Q9NSU2 369 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 HAUS2Q9NVX0 235 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
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HOXD8-201ENST00000313173 ALG1LQ6GMV1 187 aa27.14■■□□□ 1.94
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HOXD8-201ENST00000313173 BBS5Q8N3I7 341 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC63Q8NA47 563 aa27.14■■□□□ 1.94
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HOXD8-201ENST00000313173 SLC22A12Q96S37 553 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 KDM4CQ9H3R0 1056 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXD8-201ENST00000313173 HEATR9A2RTY3 570 aa27.14■■□□□ 1.93
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HOXD8-201ENST00000313173 TSPAN3O60637 253 aa27.14■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 PAMP19021 973 aa27.14■■□□□ 1.93
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HOXD8-201ENST00000313173 FSTL4Q6MZW2 842 aa27.14■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 LILRA6Q6PI73 481 aa27.14■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 CYP2S1Q96SQ9 504 aa27.14■■□□□ 1.93
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HOXD8-201ENST00000313173 SNX15Q9NRS6 342 aa27.14■■□□□ 1.93
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HOXD8-201ENST00000313173 CXCL14O95715 111 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 BGNP21810 368 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 TYK2P29597 1187 aa27.13■■□□□ 1.93
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HOXD8-201ENST00000313173 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
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HOXD8-201ENST00000313173 VAPBO95292 243 aa27.12■■□□□ 1.93
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HOXD8-201ENST00000313173 HDCP19113 662 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 ARNTP27540 789 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 GABRR2P28476 465 aa27.12■■□□□ 1.93
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HOXD8-201ENST00000313173 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 RNF43Q68DV7 783 aa27.12■■□□□ 1.93
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HOXD8-201ENST00000313173 FEM1CQ96JP0 617 aa27.12■■□□□ 1.93
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HOXD8-201ENST00000313173 SIRPB2Q5JXA9 342 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZNB5 142 aa27.11■■□□□ 1.93
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HOXD8-201ENST00000313173 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 TSSK1BQ9BXA7 367 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC3Q9BY71 257 aa27.11■■□□□ 1.93
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