RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299529.6

CRABP1-201, Transcript of cellular retinoic acid binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRABP1, Length 772 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1-201ENST00000299529 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa15.02■□□□□ -0
CRABP1-201ENST00000299529 LMBRD1Q9NUN5 540 aa15.02■□□□□ -0
CRABP1-201ENST00000299529 DNAI1Q9UI46 699 aa15.02■□□□□ -0
CRABP1-201ENST00000299529 NEU3Q9UQ49 428 aa15.02■□□□□ -0
CRABP1-201ENST00000299529 SIK3Q9Y2K2 1263 aa15.02■□□□□ -0
CRABP1-201ENST00000299529 ACTL7AQ9Y615 435 aa15.02■□□□□ -0
CRABP1-201ENST00000299529 POM121BA6NF01 834 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 FAM72CH0Y354 149 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 EPHB6O15197 1021 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 GSRP00390 522 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 CKMT1AP12532 417 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 RABIFP47224 123 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 SEMG2Q02383 582 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 FGL2Q14314 439 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 FAM72AQ5TYM5 149 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 FAM72DQ6L9T8 149 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 FAM72BQ86X60 149 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 CCDC185Q8N715 623 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 OR2AP1Q8NGE2 309 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 FAM172AQ8WUF8 416 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 ASB12Q8WXK4 309 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 ARHGEF26Q96DR7 871 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 DUSP23Q9BVJ7 150 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 FANCLQ9NW38 375 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 NLGN3Q9NZ94 848 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 ADAM22Q9P0K1 906 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 BAHCC1Q9P281 2608 aa15.01□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 C16orf96A6NNT2 1141 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 FPGTO14772 594 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 SCAMP1O15126 338 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 RAD51BO15315 384 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 FFAR2O15552 330 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 KDELR3O43731 214 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 GJB6O95452 261 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 POP4O95707 220 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 CALB1P05937 261 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 GPD1P21695 349 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 ABCG1P45844 678 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 SGCGQ13326 291 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 FZD2Q14332 565 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 ACAP1Q15027 740 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 SYCP1Q15431 976 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 PARGQ86W56 976 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 FAM181AQ8N9Y4 354 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 C3orf20Q8ND61 904 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 DENND6BQ8NEG7 585 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 OR6K2Q8NGY2 324 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 SELENOOQ9BVL4 669 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 MAGEB5Q9BZ81 275 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 USP29Q9HBJ7 922 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 EVA1BQ9NVM1 165 aa15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 IGLON5A6NGN9 336 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 H3BM21 787 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 KRIT1O00522 736 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 NEMP1O14524 444 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 MT-CO3P00414 261 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 CSF2P04141 144 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 GP1BAP07359 652 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 GKP32189 559 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 ABL2P42684 1182 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 MYLK3Q32MK0 819 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 WDR59Q6PJI9 974 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 TMC6Q7Z403 805 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 NEK11Q8NG66 645 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 BAP1Q92560 729 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 VOPP1Q96AW1 172 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 APOLD1Q96LR9 279 aa14.99□□□□□ -0.01
CRABP1-201ENST00000299529 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms