RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 OSBPL11Q9BXB4 747 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 C3orf18Q9UK00 162 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDT5Q9UKK9 219 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 JAK1P23458 1154 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB10P61026 200 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 OMDQ99983 421 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ENTPD4Q9Y227 616 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 FMO1Q01740 532 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 PLD1Q13393 1074 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFAF6Q330K2 333 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 SFRP1Q8N474 314 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 LENG9Q96B70 501 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 RCN3Q96D15 328 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 KIFC1Q9BW19 673 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa24.4■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.39■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ANXA5P08758 320 aa24.39■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 PMF1Q6P1K2 205 aa24.39■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 GCNT7Q6ZNI0 430 aa24.39■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 POC5Q8NA72 575 aa24.39■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 RDH11Q8TC12 318 aa24.39■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 BTRCQ9Y297 605 aa24.39■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC182A6NF36 153 aa24.39■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 BMP6P22004 513 aa24.39■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 TGFB2P61812 414 aa24.39■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 C16orf62Q7Z3J2 963 aa24.39■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa24.39■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 WFS1O76024 890 aa24.39■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ACADMP11310 421 aa24.39■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.39■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGA2BP08514 1039 aa24.39■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 AAGABQ6PD74 315 aa24.39■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMA8Q8TAA3 256 aa24.39■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ACSS3Q9H6R3 686 aa24.39■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TOR4AQ9NXH8 423 aa24.39■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 GNPTGQ9UJJ9 305 aa24.39■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 DBTP11182 482 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TFEBP19484 476 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR107Q5VW38 600 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TCF12Q99081 682 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SPG21Q9NZD8 308 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 LIPMQ5VYY2 423 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 AP4B1Q9Y6B7 739 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TECPR2O15040 1411 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 NTRK1P04629 796 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 NTSP30990 170 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SGCGQ13326 291 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPKAPK3Q16644 382 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 DOK6Q6PKX4 331 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 KBTBD8Q8NFY9 601 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 STAT5AP42229 794 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF2BQ00403 316 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 C10orf107Q8IVU9 208 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS35Q96QK1 796 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CASZ1Q86V15 1759 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 HDAC3O15379 428 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 UNC93AQ86WB7 457 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.497e-6■■■■□ 20.2
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR1DQ9Y2S0 133 aa24.38■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 H7C0S8 307 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CST1P01037 141 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CASP7P55210 303 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 RD3Q7Z3Z2 195 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 AMIGO2Q86SJ2 522 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM20CQ8IXL6 584 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CHID1Q9BWS9 393 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 USP45Q70EL2 814 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP3R2Q96LZ3 170 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6A2O95222 327 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 IRF8Q02556 426 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 Q96MT0 163 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 PIAS1O75925 651 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 NAA20P61599 178 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM83AQ86UY5 434 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 QRFPRQ96P65 431 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH19Q9H159 772 aa24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPAN8P19075 237 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 EPHA3P29320 983 aa24.36■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC26A3P40879 764 aa24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms