RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261413.9

MRPS27-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRPS27, Length 2,785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS27-201ENST00000261413 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 CA3P07451 260 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ATP6V1B1P15313 513 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 HOXA9P31269 272 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 PGM1P36871 562 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ARHGDIBP52566 201 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 TPTEP56180 551 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 STX17P56962 302 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 GPM6BQ13491 265 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 EFHBQ8N7U6 833 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 TMC2Q8TDI7 906 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 TXNDC15Q96J42 360 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 DMAC2Q9NW81 257 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ANK1P16157 1881 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 A0A087X0B3 334 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 H7C4K7 107 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 RNF103O00237 685 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 PDPK1O15530 556 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 CLDN3O15551 220 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 KLHL41O60662 606 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 LILRB3O75022 631 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 MICAL2O94851 1124 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 THP07101 528 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 CTSAP10619 480 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 SFTPCP11686 197 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ZNF3P17036 446 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 PMLP29590 882 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 MAGEA1P43355 309 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 HCAR3P49019 387 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 RGS7P49802 495 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 LIG4P49917 911 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 PRAMEP78395 509 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 MYBPC1Q00872 1141 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 CDC20Q12834 499 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 SLC29A2Q14542 456 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 AKAP14Q86UN6 197 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 CCDC25Q86WR0 208 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 MGARPQ8TDB4 240 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 LRRC15Q8TF66 581 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 BTBD6Q96KE9 485 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 TNIP3Q96KP6 325 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 SNX18Q96RF0 628 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ZBP1Q9H171 429 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 CHST7Q9NS84 486 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 MBD2Q9UBB5 411 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.99□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ARL5CA6NH57 179 aa6.98□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ZNF839A8K0R7 811 aa6.98□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 TXNDC9O14530 226 aa6.98□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ADAM11O75078 769 aa6.98□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 SOD2P04179 222 aa6.98□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 CYP11A1P05108 521 aa6.98□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 GALTP07902 379 aa6.98□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 KRT3P12035 628 aa6.98□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ITIH1P19827 911 aa6.98□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
MRPS27-201ENST00000261413 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms