RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 SDHDO14521 159 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 AURKAO14965 403 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD247P20963 164 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNA5P22460 613 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 VARSP26640 1264 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 YWHAQP27348 245 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDK9P50750 372 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADIGQ0VDE8 80 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF554Q86TJ5 538 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CANT1Q8WVQ1 401 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 RANBP9Q96S59 729 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARMC7Q9H6L4 198 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 33.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 EGFL7Q9UHF1 273 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 MT-ND1P03886 318 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 C1QTNF8P60827 252 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP41Q3LFD5 358 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHSY3Q70JA7 882 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPATA22Q8NHS9 363 aa21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 M0QYT0 321 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 BEST1O76090 585 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 AHSGP02765 367 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATICP31939 592 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRIA3P42263 894 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRKAA1Q13131 559 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 POU6F1Q14863 301 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 GIPC3Q8TF64 312 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 C12orf42Q96LP6 360 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF597Q96LX8 424 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 GMEB1Q9Y692 573 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 BTBD19C9JJ37 291 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 XPOTO43592 962 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATE1O95260 518 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 MPOP05164 745 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTPN9P43378 593 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM135Q86UB9 458 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 MUC3BQ9H195 1237 aa21.48■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKRD12Q6UB98 2062 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 REP15Q6BDI9 236 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLEC6AQ6EIG7 209 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 OGFOD2Q6N063 350 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIGVQ9NUD9 493 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNTG2Q9NY99 539 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALDH3B2P48448 385 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CBX3Q13185 183 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 PHF21BQ96EK2 531 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBXL20Q96IG2 436 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 HAUS8Q9BT25 410 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 POMKQ9H5K3 350 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHST12Q9NRB3 414 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.47■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 INSRRP14616 1297 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERCC2P18074 760 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC7A2P52569 658 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 OAZ1P54368 228 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CBR4Q8N4T8 237 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ISOC1Q96CN7 298 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASB9Q96DX5 294 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 SYT17Q9BSW7 474 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLK14Q9P0G3 267 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CIDEBQ9UHD4 219 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 V9GYQ6 96 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1W2PPW3 197 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP6V1B2P21281 511 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 LAMC2Q13753 1193 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 DLG3Q92796 817 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 PARP14Q460N5 1801 aa21.46■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 AP2A1O95782 977 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 JCHAINP01591 159 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHRM3P20309 590 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRKCQQ04759 706 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms