RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.41□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SPG21Q9NZD8 308 aa6.41□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.41□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 CPA4Q9UI42 421 aa6.41□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 KLF11O14901 512 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 GRM6O15303 877 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 BLVRAP53004 296 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 CYTH1Q15438 398 aa6.4□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 TOP1MTQ969P6 601 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SH3GL3Q99963 347 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 NOD2Q9HC29 1040 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 KLRC2P26717 231 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 TTC27Q6P3X3 843 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 FAM35AQ86V20 835 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 KSR1Q8IVT5 923 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 GAD1Q99259 594 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 GRAP2O75791 330 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 MAGEA11P43364 429 aa6.4□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 CSNK2BP67870 215 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 EFEMP1Q12805 493 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 RNF135Q8IUD6 432 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.4□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 CALCAP01258 141 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 RBL1P28749 1068 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 AQP5P55064 265 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 OLR1P78380 273 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ZNF33BQ06732 778 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 TRABD2AQ86V40 505 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.4□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 DLG1Q12959 904 aa6.4□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 KRT73Q86Y46 540 aa6.4□□□□□ -1.38
SETX-201ENST00000224140 IL31RAQ8NI17 732 aa6.4□□□□□ -1.38
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SETX-201ENST00000224140 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TSPEARQ8WU66 669 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 OTUB2Q96DC9 234 aa6.4□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 COG4Q9H9E3 785 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PLLPQ9Y342 182 aa6.4□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 KLK14Q9P0G3 267 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 FKBP9O95302 570 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PRIM2P49643 509 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GRIK5Q16478 980 aa6.4□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SERAC1Q96JX3 654 aa6.4□□□□□ -1.39
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