RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Man1a1P45700 655 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wdr41Q3UDP0 460 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Elf3Q3UPW2 391 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm5168Q4KL04 211 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AcdQ5EE38 416 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 EsrrbQ61539 433 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trim21Q62191 470 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AY358078Q6UY53 465 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ssxb10Q6XAR7 170 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr20Q7TRX9 314 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf76Q8BMU0 568 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hdac7Q8C2B3 938 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Asb14Q8C6Y6 587 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rab43Q8CG50 210 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Btbd6Q8K2J9 488 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tspan33Q8R3S2 283 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rprd1aQ8VDS4 312 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Golph3Q9CRA5 298 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 3830403N18RikQ9D6C3 208 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rmdn1Q9DCV4 305 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Akap8lQ9R0L7 642 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sdk2Q6V4S5 2176 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Aldoart1A6ZI46 419 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf169E9Q7F2 694 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 E230025N22RikG5E8S3 482 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Asgr1P34927 284 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PolgP54099 1218 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf185Q62394 352 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cox8aQ64445 69 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ctdp1Q7TSG2 960 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gabbr2Q80T41 940 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kctd13Q8BGV7 329 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Il17reQ8BH06 637 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Haus1Q8BHX1 278 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Taf5Q8C092 801 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smtnl2Q8CI12 456 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cd209bQ8CJ91 325 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fbxw7Q8VBV4 629 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Asz1Q8VD46 475 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dkk4Q8VEJ3 221 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf34Q99KR6 376 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dbndd2Q9CRD4 158 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ParvbQ9ES46 365 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SrfQ9JM73 504 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Il18bpQ9Z0M9 193 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dpp6Q9Z218 804 aa21.98■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ttc23lA6H6E9 458 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdh19E9Q3A7 770 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Epha8O09127 1004 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TubP50586 505 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rps24P62849 133 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Neurog2P70447 263 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zyg11bQ3UFS0 744 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trim38Q5SZ99 471 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HiraQ61666 1015 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abcg2Q7TMS5 657 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ofcc1Q8BGX4 166 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 BroxQ8K2Q7 411 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ddx18Q8K363 660 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wnt9aQ8R5M2 365 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tti1Q91V83 1085 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cybrd1Q925G2 290 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Reg4Q9D8G5 157 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trip4Q9QXN3 581 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Enpp2Q9R1E6 862 aa21.97■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm6205E9PZS2 359 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3488M0QW81 238 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hnrnpa1P49312 320 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prickle1Q3U5C7 832 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm853Q3UNZ2 425 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ctnna2Q61301 953 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Drd1Q61616 446 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HrQ61645 1182 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ndrg1Q62433 394 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kif11Q6P9P6 1052 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MroQ7TNB4 248 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm6367Q8C6L9 287 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Appl1Q8K3H0 707 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr847Q8VFF4 312 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Srgap2Q91Z67 1071 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ddx27Q921N6 760 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pex6Q99LC9 981 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dph5Q9CWQ0 281 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tor1bQ9ER41 336 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trim44Q9QXA7 346 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gbp2Q9Z0E6 589 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa21.96■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrrk2Q5S006 2527 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vmn2r27D3YUK6 857 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lce6aD3YV94 81 aa21.95■■□□□ 1.1
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Akain1G3UWD5 69 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.6 ms