RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dusp21Q9D9D8 189 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Leng1Q9DB98 261 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rgs3Q9DC04 966 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Eif3fQ9DCH4 361 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fads3Q9JJE7 449 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dbn1Q9QXS6 706 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Catsperg2C6KI89 1145 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm5861F6VCN9 180 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 4933402N22RikF7D1B3 190 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm5152L7N200 190 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cxcr3O88410 367 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Itgb7P26011 806 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Kpnb1P70168 876 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Smad1P70340 465 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 AurkaP97477 395 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ccdc160Q3UYG1 323 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem45aQ60774 273 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 E2f7Q6S7F2 904 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Defb34Q7TNV8 81 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lrrc8dQ8BGR2 859 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 MslnlQ8C160 685 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fate1Q8CEK7 99 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Acsl5Q8JZR0 683 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ccdc58Q8R3Q6 144 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sgip1Q8VD37 806 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr697Q8VFM4 317 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Idh3bQ91VA7 384 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pcdha1Q91Y21 948 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q91Z58 1206 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Psmd9Q9CR00 222 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q9CR55 154 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Eif4e3Q9DBB5 207 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gpatch1Q9DBM1 930 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gprc5dQ9JIL6 344 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Siah3B2RWG3 268 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ncam2O35136 837 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Arpc4P59999 168 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Serpina3mQ03734 418 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Plk1Q07832 603 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nab1Q61122 486 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 MslnQ61468 625 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sema4bQ62179 823 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Exoc3l4Q6DIA2 721 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Kirrel1Q80W68 789 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q80WR5 230 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cdhr1Q8VHP6 859 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q99KU6 348 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zmynd10Q99ML0 440 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sesn3Q9CYP7 492 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 VasnQ9CZT5 673 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Adck1Q9D0L4 525 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gstt4Q9D4P7 240 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 TheglQ9DA15 459 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Efcab9Q9DAM2 216 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Galk1Q9R0N0 392 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Capn7Q9R1S8 813 aa7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ptpn3A2ALK8 913 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Kctd18E0CZ26 429 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 C87414E9PWI7 475 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r4K7N784 913 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 H2al1oL7MU04 110 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ptpn9O35239 593 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nek2O35942 443 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q32P12 615 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slfn4Q3UV66 602 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Xlr3bQ6P205 226 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cypt2Q6P924 180 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tas2r102Q7M717 329 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 March4Q80TE3 409 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Clec1aQ8BWY2 269 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 TwnkQ8CIW5 685 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Colec12Q8K4Q8 742 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 HibchQ8QZS1 385 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1499Q8VG65 314 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Aim2Q91VJ1 354 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Znf622Q91VY9 476 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ctu1Q99J10 420 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 NepnQ9CQ76 512 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ppa1Q9D819 289 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Atp5hQ9DCX2 161 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cyth1Q9QX11 398 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ltbp1Q8CG19 1712 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Glipr1l3A0A1W2P7V2 236 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ccdc163A2AGD7 326 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Patl2A2ARM1 529 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1023A2ASU6 311 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 MaptP10637 733 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 PrkchP23298 683 aa7.12□□□□□ -1.27
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.2 ms