RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000066279.10

Sh3bp4-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp4, Length 4,995 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 IlkapQ8R0F6 392 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 March2Q99M02 246 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tex12Q9CR81 123 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zbed3Q9D0L1 228 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Serpini2Q9JK88 405 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cntnap4Q99P47 1310 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Scrg1O88745 98 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gas2P11862 314 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 ItgavP43406 1044 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gabrb2P63137 512 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ampd1Q3V1D3 745 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Traf3Q60803 567 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Larp4bQ6A0A2 741 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Trpm4Q7TN37 1213 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Slc35f5Q8R314 524 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cdh13Q9WTR5 714 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Slfn8B1ARD8 910 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Mtx3D3YTP3 312 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm6811E9Q3Y8 510 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tbc1d10aP58802 500 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pld5Q3UNN8 536 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tcf4Q60722 670 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ubp1Q811S7 540 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pyhin1Q8BV49 420 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Catsper4Q8BVN3 442 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Epn2Q8CHU3 595 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 DolkQ8R2Y3 534 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr1467Q8VFW1 308 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ubxn6Q99PL6 442 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 GabrqQ9JLF1 638 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Hey2Q9QUS4 339 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Acox2Q9QXD1 681 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Map3k14Q9WUL6 942 aa13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zfp277E9Q6D6 583 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Calhm3J3QMI4 347 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 B020004C17RikJ3QP07 232 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zw10O54692 779 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Proser1Q5PRE5 913 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cntn2Q61330 1040 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Prrg3Q6PAQ9 231 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Fam205cQ80YD3 371 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Taf5Q8C092 801 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 BicralQ8CHH5 1074 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pth2rQ91V95 546 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Dnajc9Q91WN1 259 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 GsdmcQ99NB5 468 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Sike1Q9CPR7 207 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Trim13Q9CYB0 407 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 ArskQ9D2L1 553 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ice1E9Q286 2241 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm28897A0A087WP44 222 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Zbed5B2RPU8 756 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ptchd4B9EKX1 904 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Unc5cO08747 931 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 AprtP08030 180 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 BpgmP15327 259 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 AcadmP45952 421 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rab10P61027 200 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Cntn3Q07409 1028 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 BC030870Q3V2G4 71 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Camkk2Q8C078 588 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pacs1Q8K212 961 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gprc5bQ923Z0 410 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Katnal2Q9D3R6 539 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 P2yr13Q9D8I2 337 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tsga13Q9DA17 273 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Znf711A2ANX9 761 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr1022L7MTT3 315 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 ShdO88834 343 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 PamP97467 979 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Arhgef9Q3UTH8 516 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Grik1Q60934 836 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tssk1bQ61241 365 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr26Q7TRB7 308 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Atp2c1Q80XR2 918 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Il17reQ8BH06 637 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Eme1Q8BJW7 570 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr1302Q8VGE9 315 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Prdm5Q9CXE0 599 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ephx1Q9D379 455 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Tmem68Q9D850 329 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Ift46Q9DB07 301 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Olfr933Q9EQA0 308 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Klrc1Q9Z202 244 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Gm17615E9Q9P2 165 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Pik3cdO35904 1043 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Rps7P62082 194 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Clec4fP70194 548 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 March4Q80TE3 409 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 1700001J03RikQ80ZR8 219 aa13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 Anapc2Q8BZQ7 837 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.7 ms