RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 REP15Q6BDI9 236 aa20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 ACOT1Q86TX2 421 aa20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 FAM131BQ86XD5 332 aa20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 TRPC4APQ8TEL6 797 aa20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 SCYL1Q96KG9 808 aa20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
PMS1-222ENST00000639501 ARMC7Q9H6L4 198 aa20.77■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.77■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
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PMS1-222ENST00000639501 STYXQ8WUJ0 223 aa20.75■□□□□ 0.91
PMS1-222ENST00000639501 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.75■□□□□ 0.91
PMS1-222ENST00000639501 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PMS1-222ENST00000639501 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa20.75■□□□□ 0.91
PMS1-222ENST00000639501 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PMS1-222ENST00000639501 XPR1Q9UBH6 696 aa20.75■□□□□ 0.91
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